关于事业单位病假超过三个月的考核等次计算问题，这主要取决于事业单位内部的规章制度以及地方性的相关规定，但我可以从一般性的角度为你提供一些分析和建议：
依据事业单位内部规章制度：
- 事业单位通常会制定自己的考核办法，其中会明确规定病假期间的考核处理方式。如果病假超过三个月，单位可能会根据具体情况，如病假的实际原因、员工的过往表现等，来决定考核等次。
- 有些单位可能会规定，病假期间不参与考核，或者考核等次为“基本合格”或“不合格”，但这并非绝对，具体还需看单位的规定。
参考地方性规定：
- 不同地区的事业单位管理可能有所不同，有些地方可能会出台专门的规定，对病假期间的考核进行明确。例如，某些地方可能规定，病假超过一定期限（如三个月），考核等次不得高于“合格”或需进行特殊处理。
- 因此，了解并参考当地的相关规定也是非常重要的。
考虑病假期间的实际情况：
- 病假期间，员工可能因身体原因无法正常工作，这会影响其工作表现和考核结果。单位在考核时，应充分考虑员工的实际情况，避免不公平的考核。
- 如果员工在病假前表现优秀，且病假原因合理，单位在考核时可能会给予一定的宽容和理解。
建议与单位沟通：
- 如果你对病假期间的考核等次有疑问或不满，建议首先与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解考核的具体依据和标准。
- 通过沟通，你可以更好地了解自己的考核情况，并可能争取到更合理的考核结果。
法律背景与建议：
- 虽然具体的考核等次计算可能因单位而异，但单位在制定考核办法时，应遵循公平、公正、公开的原则，确保考核结果的合理性和合法性。
- 如果单位在考核过程中存在不公平、不公正的行为，你可以通过合法途径维护自己的权益，如向单位上级部门反映情况或寻求法律援助。
可能后果：
- 如果病假期间的考核等次不理想，可能会影响你的晋升、薪酬调整等职业发展方面。因此，了解并关注自己的考核情况是非常重要的。
总结与进一步思考：
- 事业单位病假超过三个月的考核等次计算是一个复杂的问题，涉及单位内部规章制度、地方性规定以及病假期间的实际情况等多个方面。
- 如果你对此有疑问或不满，建议首先与单位沟通了解具体情况，并考虑咨询专业人士（如我，贾志波律师，专注于劳动纠纷领域）以获取更具体的法律建议。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。