居民区房屋出租给加工厂是否合法需分情况讨论，关键取决于是否符合当地规划用途及是否取得相关许可，具体分析如下：

1. 若房屋规划用途为“居住”且未变更用途，则直接出租给加工厂违法
   根据《民法典》第279条及《商品房屋租赁管理办法》第6条，业主不得违反法律、法规以及管理规约，将住宅改变为经营性用房。若房屋产权证或规划用途明确标注为“居住”，且未通过合法程序变更用途（如取得利害关系业主同意、办理工商登记等），直接出租给加工厂属于擅自改变房屋用途，可能面临行政处罚（如责令限期改正、罚款），且租赁合同可能因违反法律强制性规定被认定无效。

2. 若房屋规划用途为“商住两用”或已合法变更用途，则需进一步审查是否符合其他条件

   • 工商登记与环保要求：加工厂需依法办理营业执照，且经营项目需符合当地产业政策（如禁止在居民区设立高污染、高噪音行业）。若涉及生产加工，还需通过环保审批（如排污许可、环境影响评价），否则可能因“无证经营”或“环保违法”被责令停业。
     
   • 利害关系业主同意：即使房屋用途已变更，根据《民法典》第279条，业主将住宅改变为经营性用房的，应当经有利害关系的业主一致同意（如同一楼栋业主）。若未取得同意，利害关系业主可向法院起诉要求停止侵害、排除妨碍。
     
   • 消防与安全标准：加工厂需符合消防安全要求（如设置消防通道、配备灭火器材），否则可能因安全隐患被责令整改或查封。

3. 特殊情形：疫情期间或临时性使用
   若加工厂仅为临时性、低污染、低噪音的作业（如手工编织、小型包装），且已取得社区或街道办的临时许可，可能被允许短期使用。但此类情形需严格限定范围，且不得影响其他业主正常生活，否则仍可能被叫停。

建议：

• 出租前：核查房屋产权证规划用途，确认是否允许经营；向当地工商、环保、消防部门咨询加工厂是否符合准入条件；提前与利害关系业主沟通并取得书面同意。
  
• 承租后：督促加工厂办理相关证照，定期检查是否存在噪音、污染等扰民行为，避免因连带责任承担法律风险。
  

若有具体案例（如房屋所在地、加工厂类型），可进一步分析合规性及风险点。