结论：老板在工伤情况下扣违约金和三个月工资的行为，通常是不合法的。具体分析如下：

1. 关于扣违约金：

   • 法律背景：根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者约定违约金的情形主要限于两种：一是用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训，并约定服务期的；二是用人单位与劳动者在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项，或竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿的。若工伤情况并不属于上述可以约定违约金的情形，那么老板扣违约金的行为就是不合法的。
   • 法律建议：如果老板以工伤为由扣违约金，你可以首先查看劳动合同中是否有相关约定，并确认该约定是否符合《劳动合同法》的规定。如果不符合，你有权拒绝支付违约金，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。

2. 关于扣三个月工资：

   • 法律背景：根据《劳动法》和《工资支付暂行规定》，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。在工伤期间，劳动者享有停工留薪期待遇，即原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。因此，老板在工伤期间扣工资，特别是扣三个月工资的行为，显然是违法的。
   • 法律建议：如果老板在工伤期间扣工资，你可以首先与老板进行协商，要求其按照法律规定支付工资。如果协商无果，你可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求老板支付拖欠的工资，并可能要求支付赔偿金。

进一步思考：

• 在处理此类纠纷时，保留相关证据至关重要。例如，劳动合同、工资条、工伤认定书、医疗证明等文件都是证明你权益的关键证据。
• 如果对法律程序不熟悉或担心自己的权益得不到充分保障，可以考虑寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你更好地维护自己的权益。

行动建议：

• 首先与老板进行友好协商，尝试解决问题；
• 如果协商无果，及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
• 在整个过程中，保留好相关证据，以备不时之需；
• 如有需要，随时向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。