《土地权属争议调查处理办法》确实规定了政府在处理土地权属争议时取得的证据需要交由对方质证。以下是对此问题的详细分析：

法律依据与规定

根据《土地权属争议调查处理办法》的相关规定，在处理土地权属争议案件时，国土资源行政主管部门（即政府相关部门）在调查取证阶段会收集各种证据，包括书证、物证、视听资料、证人证言、当事人的陈述、鉴定结论以及勘验笔录、现场笔录等。这些证据在形成后，并非直接作为定案依据，而是需要经过质证程序，即交由争议双方进行质证，以确保证据的真实性、合法性和关联性。

质证程序的重要性

1. 保障当事人权益：质证程序是当事人行使陈述权、申辩权的重要方式。通过质证，当事人可以了解对方提出的证据内容，并有机会提出反驳意见或提供相反证据，从而维护自己的合法权益。
2. 确保案件公正处理：质证程序有助于查明案件事实，确保案件处理的公正性。通过双方对证据的质证和辩论，可以揭示证据的真实性和证明力，为行政机关或法院作出公正裁决提供依据。

质证程序的具体实施

1. 证据出示：在调查处理过程中，国土资源行政主管部门会将取得的证据以适当方式出示给争议双方，确保双方都有机会了解证据内容。
2. 质证辩论：争议双方在了解证据后，可以就证据的真实性、合法性、关联性以及证明力大小等问题进行质证和辩论。双方可以提出自己的观点和理由，并可以提供相反证据进行反驳。
3. 记录与认定：国土资源行政主管部门会对质证过程进行记录，并根据质证结果对证据进行认定。对于经过质证且双方无异议的证据，可以作为定案依据；对于存在争议的证据，则需要进一步调查核实或依法不予采信。

实际应用中的注意事项

1. 及时质证：争议双方应在收到证据后及时进行质证，避免因拖延时间而影响案件处理进度。
2. 充分准备：在进行质证前，争议双方应充分准备相关材料和理由，以便在质证过程中有效维护自己的权益。
3. 遵守程序：争议双方应遵守质证程序的相关规定，尊重对方权利，不得进行恶意攻击或干扰质证过程。

建议：在处理土地权属争议案件时，如果涉及政府取得的证据需要交由对方质证的情况，争议双方应积极配合质证程序，确保案件处理的公正性和合法性。如果对质证程序或证据认定有疑问或争议，可以及时向相关部门咨询或寻求法律帮助。如有任何疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。