被公司签了综合工时制，你首先需要明确的是，综合工时制本身并不违法，但关键在于公司是否依法进行了申请和审批，以及是否按照综合工时制的规定来安排你的工作时间和支付加班费。以下是我从多个角度为你详细分析的情况：
一、综合工时制的合法性
申请与审批：
- 综合工时制并非公司可以随意采用的，它需要经过劳动行政部门的审批。如果公司没有依法申请并获得审批，那么即使与你签订了综合工时制的合同，也是无效的。
- 法律依据：根据《劳动法》及相关规定，企业因生产特点不能实行标准工时制的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，包括综合工时制。
合同内容：
- 即使公司获得了综合工时制的审批，合同中也应明确约定你的工作时间、休息休假、加班费支付等条款。如果合同内容模糊或存在不公平条款，你有权要求公司进行修改或补充。
二、综合工时制下的工作时间与加班费
工作时间安排：
- 综合工时制下，你的工作时间可能不是固定的每天8小时，而是以周、月、季或年为周期来综合计算。但无论如何，你的平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
- 如果公司安排你的工作时间超过了法定标准，那么超出部分应视为加班。
加班费支付：
- 在综合工时制下，加班费支付也有其特殊性。如果公司在周期内安排你加班，应按照法律规定支付加班费。具体来说，工作日加班应支付不低于工资150%的加班费，休息日加班又不能安排补休的，应支付不低于工资200%的加班费，法定节假日加班则应支付不低于工资300%的加班费。
- 计算公式（以工作日加班为例）：
- 加班费 = 月工资基数 ÷ 21.75天 ÷ 8小时 × 加班小时数 × 150%
- （其中，21.75天是月平均计薪天数，8小时是标准工作日工作时间）
三、你的权益保护
了解公司政策：
- 首先，你需要了解公司是否真的获得了综合工时制的审批，以及合同中关于工作时间和加班费的具体约定。
保留证据：
- 保留好与工作时间、加班相关的证据，如考勤记录、加班通知、工资条等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
与公司协商：
- 如果发现公司存在违法行为或不合理安排，你可以先与公司进行协商，要求公司改正并支付应得的加班费。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，你可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的处理
- 如果公司未经审批擅自实行综合工时制，或者虽然获得了审批但未按照综合工时制的规定来安排你的工作时间和支付加班费，那么这些行为都是违法的。你有权要求公司立即改正，并可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。
总结来说，被公司签了综合工时制并不可怕，关键在于公司是否依法行事。如果你对公司的做法有任何疑问或不满，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律建议和帮助。