结论：即使工资是由别的公司发放，只要您与实际工作的公司存在事实劳动关系，您仍然可以就未签劳动合同等劳动争议问题申请劳动仲裁。

详细分析

1. 事实劳动关系的认定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动关系的建立并不完全依赖于书面劳动合同的签订。只要劳动者与用人单位之间存在实际用工关系，即劳动者为用人单位提供劳动，接受用人单位的管理，并由用人单位支付劳动报酬，就构成了事实劳动关系。
   • 在您的情况下，尽管工资是由别的公司发放，但如果您实际上是在为另一家公司工作，接受该公司的管理，并为其提供劳动，那么您与该公司之间就存在事实劳动关系。

2. 未签劳动合同的法律后果：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条：“用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。”
   • 这意味着，如果您与用人单位存在事实劳动关系但未签订书面劳动合同，您有权要求用人单位支付双倍工资作为补偿。

3. 工资发放公司的角色：

   • 工资由别的公司发放，可能涉及到代发工资、关联交易或劳务派遣等情形。但这并不改变您与实际工作公司之间的事实劳动关系。
   • 如果工资发放公司与实际工作公司之间存在关联关系或劳务派遣协议，您可能需要根据具体情况来确定责任主体。但无论如何，这都不影响您就未签劳动合同问题申请劳动仲裁的权利。

4. 劳动仲裁的申请流程：

   • 您需要准备相关证据，如工作证、考勤记录、工资条（尽管是由别的公司发放，但可以作为证明劳动关系的辅助证据）、同事证言等，以证明您与用人单位之间存在事实劳动关系。
   • 然后，您可以向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，要求用人单位支付未签劳动合同的双倍工资等补偿。

建议

• 收集证据：尽快收集能够证明您与用人单位之间存在事实劳动关系的证据，如上述提到的工作证、考勤记录等。
• 咨询专业意见：虽然我已经为您提供了一些基本的法律建议，但劳动争议案件往往涉及复杂的法律关系和证据认定。因此，我建议您在申请劳动仲裁前，进一步向我咨询，以便更准确地把握案件走向和维权策略。
• 及时申请仲裁：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，您应及时申请仲裁，以免错过时效期间。

如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。