结论：货车司机因老板不发工资而拿运费抵扣的行为，是否违法需分情况讨论。一般情况下，这种行为可能构成违法，但在特定条件下，司机可能享有一定的抗辩权或留置权。

1. 一般情况下，拿运费抵扣工资可能违法

• 法律背景：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若用人单位拖欠工资，劳动者应通过合法途径维权，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
• 行为分析：司机直接拿运费抵扣工资，未经老板同意，可能构成对老板财产权的侵犯。这种行为可能违反了《中华人民共和国民法典》中关于财产权保护的规定，老板有权要求司机返还运费，并可能追究司机的法律责任。

2. 特定条件下，司机可能享有抗辩权或留置权

• 抗辩权：如果司机与老板之间的劳动合同或相关协议中明确约定了工资支付方式、时间等，且老板存在明显违约行为（如长期拖欠工资），司机在特定情况下可能享有抗辩权，即有权拒绝继续提供劳务直至工资得到支付。但这并不意味着司机可以直接拿运费抵扣工资，而是应通过合法途径主张自己的权益。
• 留置权：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债权人按照合同约定占有债务人的动产，债务人不履行到期债务，债权人有权留置该财产，并有权就该财产优先受偿。然而，在劳动关系中，司机作为劳动者并不直接享有留置权，因为留置权通常适用于平等主体之间的民事合同关系。但在某些特殊情况下，如司机为老板提供了运输服务并垫付了相关费用（如油费、过路费等），且这些费用与运费紧密相关，司机可能在一定程度上享有对运费的留置权，以保障自己的合法权益。但这种留置权的行使需严格符合法律规定，并需通过合法途径主张。

3. 法律建议

• 沟通协商：司机应首先与老板进行沟通协商，明确工资支付情况，并尝试达成和解协议。
• 合法维权：若沟通无果，司机应向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，通过合法途径维护自己的权益。
• 保留证据：司机应保留好与老板之间的劳动合同、工资支付记录、运输服务合同等相关证据，以便在维权过程中证明自己的主张。

4. 可能的法律后果

• 若司机行为违法：老板有权要求司机返还运费，并可能追究司机的法律责任，如要求赔偿损失、支付违约金等。
• 若司机行为合法但方式不当：即使司机在一定程度上享有抗辩权或留置权，但直接拿运费抵扣工资的方式可能不当，仍可能面临一定的法律风险。因此，司机应通过合法途径主张自己的权益，避免采取过激行为。

总结：货车司机因老板不发工资而拿运费抵扣的行为，在一般情况下可能构成违法。司机应通过合法途径维护自己的权益，如沟通协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。在特定条件下，司机可能享有一定的抗辩权或留置权，但需严格符合法律规定，并通过合法途径主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。