货车司机拿不到运费直接把货扣了是违法的。

首先，从法律角度来看，货车司机与货主或托运人之间通常存在运输合同关系。根据合同法的相关规定，双方应当按照约定履行自己的义务。如果货主或托运人未按照约定支付运费，货车司机可以依法追究其违约责任，但不能直接扣留货物作为抵押或补偿。

其次，货车司机直接扣货的行为可能构成侵权行为。货物是货主或托运人的财产，货车司机无权擅自处分或留置。如果货车司机擅自扣留货物，可能会侵犯货主或托运人的财产权，从而承担侵权责任。

此外，货车司机还可以采取其他合法途径来维护自己的权益。例如，可以与货主或托运人协商解决运费支付问题；如果协商不成，可以向法院提起诉讼，要求货主或托运人支付运费并承担违约责任。在诉讼过程中，货车司机还可以申请法院对货物进行保全，以确保自己的权益得到保障。

综上所述，货车司机拿不到运费直接把货扣了是违法的。货车司机应当通过合法途径来维护自己的权益，而不是采取擅自扣留货物的违法行为。如果遇到类似问题，建议货车司机及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。