不支付运费而将货物扣押是否违法，需根据具体情况判断。若承运人依法享有留置权并合法行使，则扣押货物不构成违法；反之，若违反法律规定或当事人约定，则可能构成违法。
一、合法扣押（行使留置权）
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第八百三十六条，托运人或者收货人不支付运费、保管费或者其他费用的，承运人对相应的运输货物享有留置权，但当事人另有约定的除外。
适用条件：
- 债权已到期：如运输合同中约定的运费支付期限已到，托运人或收货人未支付。
- 合法占有货物：承运人基于运输合同合法占有货物。
- 同一法律关系：留置的货物与未支付的运费应基于同一运输合同关系产生。
行使程序：
- 承运人应妥善保管留置财产，并通知债务人。双方可约定债务履行期限，未约定或约定不明的，应给予债务人六十日以上履行期限（鲜活易腐等不易保管的动产除外）。
- 债务人逾期未履行，承运人可与债务人协议折价或以拍卖、变卖所得价款优先受偿。
二、违法扣押
超出留置权范围：
- 如承运人以旧账未清为由扣押新货物，因新旧运费不属于同一法律关系，此扣押行为违法。
- 未按照法律规定的程序行使留置权，如未给予债务人合理履行期限即擅自处分留置财产。
滥用扣押权利：
- 承运人以扣押货物为手段谋取不正当利益或给债务人造成不合理损失，如故意拖延归还货物导致变质、贬值，或索要高额费用才肯归还。
违反当事人约定：
- 如承运人、收货人及托运人间有特别约定处理不支付费用的情况，而承运人仍擅自扣留货物，则构成违法，涉嫌侵占他人财物。
三、建议与注意事项
- 承运人在行使留置权时，应确保行为的合法性和合理性，严格遵守法律规定和合同约定。
- 如遇到运费纠纷，承运人应首先尝试通过协商或法律途径解决，而不是直接扣押货物。
- 托运人或收货人也应按时支付运费，避免不必要的法律纠纷。
综上所述，不支付运费而将货物扣押的合法性取决于具体情况。承运人在行使权利时，必须依法、合规进行，确保自身行为的合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。