结论前置：老板以结运费的方法发工资是否违法，需根据具体情况判断，若运费与工资性质不符或存在偷逃税费等违法行为，则可能违法；若仅为支付方式调整且合法合规，则不一定违法。以下从不同角度进行分析：

1. 工资支付方式的合法性

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。法律并未明确规定工资必须通过何种具体方式支付，如银行转账、现金支付等，只要确保工资能够准确、及时地到达劳动者手中，且支付金额与劳动合同约定一致，通常即视为合法。

若老板以结运费的方式支付工资，关键在于这种支付方式是否改变了工资的本质属性。如果运费实际上就是劳动者应得的工资，只是以运费的名义进行支付，且没有偷逃税费等违法行为，那么这种支付方式可能并不违法。然而，如果运费与工资性质不符，或者存在通过运费形式偷逃税费等违法行为，那么这种支付方式就可能构成违法。

2. 可能的违法行为及后果

• 偷逃税费：如果老板通过结运费的方式支付工资，实际上是为了偷逃个人所得税等税费，那么这种行为就违反了税收法律法规，可能面临税务处罚，包括补缴税款、滞纳金以及罚款等。
• 违反劳动合同：如果劳动合同中明确规定了工资的支付方式和金额，而老板却以结运费的方式支付，且支付金额与合同约定不符，那么这种行为就违反了劳动合同，劳动者有权要求老板按照合同约定支付工资，并可能因此解除劳动合同并要求经济补偿。
• 损害劳动者权益：如果结运费的方式导致劳动者无法及时、准确地收到工资，或者因此产生了额外的费用（如转账手续费等），那么这种行为就损害了劳动者的合法权益，劳动者有权要求老板承担相应的赔偿责任。

3. 法律建议

• 核实支付性质：劳动者应核实老板以结运费方式支付工资的具体性质，确保这种支付方式没有改变工资的本质属性，且没有偷逃税费等违法行为。
• 保留证据：劳动者应保留好与工资支付相关的所有证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
• 及时维权：如果劳动者发现老板以结运费方式支付工资存在违法行为或损害了自己的合法权益，应及时向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。

举例说明：假设劳动者与老板签订的劳动合同中明确规定每月工资为5000元，但老板却以结运费的方式每月只支付了4000元，并声称其余1000元作为运费已经支付。在这种情况下，劳动者有权要求老板按照合同约定支付剩余的1000元工资，并可能因此解除劳动合同并要求经济补偿。

总结与引导：老板以结运费的方法发工资是否违法，需根据具体情况判断。如果你对此有疑问或遇到了相关问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。