公司员工收到运费不上交是否违法，这主要取决于员工的具体职责、公司规定以及相关法律法规的适用情况。以下是从不同角度进行的分析：
员工职责与合同约定：
- 如果员工在劳动合同或公司规章制度中明确被赋予了收取运费并上交的职责，那么员工不上交运费就构成了违反合同约定或公司规定的行为。这种情况下，员工可能需要承担违约责任，公司也有权根据内部规定对员工进行相应的处理。
职务侵占或贪污：
- 如果员工利用职务之便，将收取的运费非法占为己有，且数额较大，那么这种行为可能构成职务侵占罪或贪污罪（如果员工是国家工作人员）。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为；贪污罪则是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。
民事侵权：
- 即使员工的行为不构成犯罪，但如果其不上交运费的行为给公司造成了经济损失，公司也有权要求员工承担民事赔偿责任。这通常涉及到员工与公司之间的债权债务关系，公司可以通过民事诉讼等途径来维护自己的合法权益。
公司内部管理：
- 从公司内部管理的角度来看，员工不上交运费也可能违反了公司的财务管理制度或业务流程。公司可以根据内部规定对员工进行警告、罚款、解雇等处理，以维护公司的正常运营秩序。
建议与后果：
- 对于员工而言，如果收到运费，应当按照公司规定或合同约定及时上交，避免给自己带来不必要的法律风险。
- 对于公司而言，应当建立健全的财务管理制度和业务流程，明确员工的职责和权限，加强对员工行为的监督和管理，以防止类似事件的发生。
- 如果员工不上交运费的行为已经发生，公司应当及时采取措施进行调查和处理，必要时可以寻求法律帮助来维护自己的合法权益。
总结：公司员工收到运费不上交是否违法，需要根据具体情况来判断。如果员工的行为违反了合同约定、公司规定或相关法律法规，那么就可能构成违法或犯罪行为，需要承担相应的法律责任。因此，建议员工和公司都应当加强对相关法律法规的学习和了解，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。