公司不付司机运费是违法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律关系角度

司机为公司提供运输服务，与公司之间形成了运输合同关系（如果双方有书面合同则更明确，没有书面合同但实际履行了运输服务，也构成事实上的合同关系）。在这种合同关系中，司机有义务按照公司的要求完成运输任务，而公司则有义务按照约定支付运费。公司不支付运费，属于违反合同约定的行为，构成违约。

法律依据角度

根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条规定：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。” 公司不支付运费，就是未履行合同中的付款义务，司机有权要求公司继续支付运费，并可以要求公司承担因违约造成的损失，比如司机为追讨运费而产生的合理费用（如交通费、诉讼费等）。

实际操作与后果角度

1. 协商解决：司机可以先尝试与公司进行协商，明确告知公司不支付运费是违法行为，要求公司按照约定支付运费。这种方式成本较低，效率较高，如果公司能够认识到自己的错误并积极解决，问题往往能够得到快速解决。
2. 投诉举报：如果协商无果，司机可以向当地的劳动监察部门或者交通运输管理部门进行投诉举报。这些部门有权对公司的违法行为进行调查和处理，可能会对公司进行警告、罚款等行政处罚，同时也会督促公司支付运费。
3. 法律诉讼：司机还可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。在诉讼过程中，司机需要提供相关证据，如运输合同、运输单据、与公司沟通的记录等，以证明公司存在不支付运费的行为。如果法院判决公司支付运费，而公司仍然拒不执行，司机还可以申请法院强制执行。

建议：司机在遇到公司不支付运费的情况时，要保留好相关证据，如运输合同、运输过程中的签收单、与公司的沟通记录（包括聊天记录、通话录音等）等，以便在协商、投诉或诉讼过程中能够有力地证明自己的主张。如果对具体的法律程序和操作不太了解，可以随时向我咨询，我会为你提供详细的法律指导。