结论：向村长申请集体股份开会时本人不在场是否合法，需分情况讨论，主要取决于相关法律法规、集体章程以及具体程序是否合规。以下是详细分析：

1. 法律法规层面
   根据《村民委员会组织法》第二十四条，涉及村民利益的重大事项（如集体资产处置、股份分配等）需经村民会议或村民代表会议讨论决定。若会议程序合法（如提前公告、参会人数符合法定比例、表决方式合规），即使本人未到场，但通过授权委托他人表决或书面表达意见，仍可能被认定为合法。但若未履行法定程序（如未通知本人、未提供表决机会），则可能侵犯村民权益，属于程序违法。

2. 集体章程层面
   若村集体制定了明确的章程或规则（如《股份经济合作社章程》），需优先审查其中关于会议召集、表决方式的规定。例如，章程可能规定“股东因故不能到场可书面委托他人代为表决”，此时本人不在场但委托合规即合法；若章程明确要求“必须本人到场”，则缺席可能影响决议效力。

3. 具体程序合规性
   即使法律法规或章程允许缺席表决，仍需满足以下条件：

   • 通知义务：会议召集人需提前通知所有股东（包括本人），告知会议时间、地点、议题；
     
   • 表决方式：若本人未到场，需通过书面委托、电子投票等可追溯的方式表达意见；
     
   • 决议公示：会议结果需公示，允许股东在合理期限内提出异议。
     若程序存在瑕疵（如未通知、伪造签字），决议可能被撤销或确认无效。

建议：

• 若您认为会议程序违法或侵犯权益，可向乡镇政府反映，要求其调查并责令改正；
  
• 若涉及具体决议争议，可收集证据（如通知记录、章程文本、表决材料）向法院提起民事诉讼，主张决议无效或撤销；
  
• 未来可推动完善集体章程，明确缺席表决规则，减少纠纷。
  

如有进一步细节（如是否收到通知、章程具体条款），可向我补充说明，我会为您具体分析。