劳动局不认定此类情况为工伤，从法律角度分析，其做法在特定条件下是合理的。以下从不同角度为你详细分析：
法律关系角度
劳动关系认定：
- 工伤认定的前提是存在劳动关系。公司包活给无资质的自然人，工人在自然人手里干活，这种情况下，工人与公司之间往往不构成直接的劳动关系。通常，工人与自然人之间可能形成雇佣关系或者劳务关系，而与公司之间缺乏直接的劳动管理、工资支付等劳动关系特征。
- 根据《工伤保险条例》的规定，工伤认定主要针对的是与用人单位存在劳动关系的劳动者。如果无法证明工人与公司之间存在劳动关系，劳动局不认定工伤是符合法律规定的。
例外情形：
- 然而，也存在一些例外情况。如果公司对工人的工作进行了实质性的管理、指挥和监督，并且工人受公司的规章制度约束，同时公司向工人支付工资等劳动报酬，那么即使工人是通过自然人介绍或组织来工作的，也可能被认定为与公司存在事实劳动关系。在这种情况下，劳动局应当认定工伤。
责任承担角度
自然人责任：
- 如果工人与自然人之间形成雇佣关系，那么根据《民法典》中关于侵权责任的规定，工人在工作中受伤，自然人作为雇主应当承担相应的赔偿责任。这包括支付医疗费、误工费、护理费等因受伤而产生的合理费用。
公司连带责任：
- 公司将工程包给无资质的自然人，如果自然人没有相应的施工资质或者安全生产条件，导致工人在工作中受伤，公司可能需要承担连带赔偿责任。这是因为公司选择了无资质的自然人进行施工，存在选任过失，应当对工人的损失承担一定的责任。但这种责任与工伤赔偿责任是不同的，它属于民事侵权赔偿责任。
实际操作角度
劳动局认定流程：
- 劳动局在认定工伤时，会严格按照法律法规的规定进行审查。他们会要求申请人提供能够证明劳动关系存在的证据，如劳动合同、工资支付记录、工作证等。如果申请人无法提供这些证据，劳动局可能会以无法证明劳动关系为由不认定工伤。
工人维权途径：
- 如果工人认为自己的情况应当被认定为工伤，但劳动局不予认定，工人可以通过法律途径进行维权。例如，工人可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认与公司之间存在劳动关系；或者向人民法院提起诉讼，要求公司承担相应的赔偿责任。
给你的建议：
- 如果你或你身边的人遇到了这种情况，建议首先收集能够证明与公司存在劳动关系的证据，如工作证、工资支付记录、工作安排等。
- 如果无法证明劳动关系，可以考虑通过民事侵权诉讼的途径来维护自己的权益，要求自然人和公司承担相应的赔偿责任。
- 在整个过程中，建议咨询专业律师的意见，以便更好地了解自己的权益和维权途径。
希望以上分析能够对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。