结论：公司注销后发现误申报员工工资并主动联系税务及时更正申报，一般情况下，若不存在故意隐瞒或虚假申报以逃避税收等违法行为，公司及其相关责任人员通常不会因此承担严重的法律责任，但仍需根据具体情况配合税务机关的调查和处理，并可能面临一定的行政责任或补缴税款及滞纳金等后果。以下是对此问题的详细分析：
一、法律责任分析
行政责任：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，纳税人未按照规定的期限办理纳税申报和报送纳税资料的，或者扣缴义务人未按照规定的期限向税务机关报送代扣代缴、代收代缴税款报告表和有关资料的，由税务机关责令限期改正，可以处二千元以下的罚款；情节严重的，可以处二千元以上一万元以下的罚款。但在此情况下，由于公司是主动联系税务机关进行更正申报，且误申报并非出于故意隐瞒或虚假申报的目的，因此，税务机关在查明事实后，通常会根据具体情况从轻或免除行政处罚。
补缴税款及滞纳金：
- 如果误申报导致少缴了税款，公司需要按照税务机关的要求补缴税款及相应的滞纳金。滞纳金通常按照少缴税款的万分之五每日计算，从税款滞纳之日起算。
刑事责任：
- 在一般情况下，误申报员工工资并不构成犯罪，因此不会承担刑事责任。但是，如果公司存在故意隐瞒或虚假申报以逃避税收等违法行为，且情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。不过，根据您的描述，公司是主动联系税务机关进行更正申报，因此不涉及刑事责任的问题。
二、后续行动建议
积极配合税务机关的调查和处理：
- 公司应主动与税务机关沟通，说明误申报的原因和情况，提供相关的证明材料和账目资料，以便税务机关尽快查明事实并作出处理决定。
及时补缴税款及滞纳金：
- 如果税务机关认定公司需要补缴税款及滞纳金，公司应按照要求及时缴纳，以避免进一步的法律后果。
加强内部管理和审核：
- 公司应加强对财务和税务申报的内部管理和审核，确保申报的准确性和及时性，避免类似误申报的情况再次发生。
三、特殊情况考虑
- 如果公司注销后，其法人资格已经消灭，但原公司的股东或实际控制人可能仍需对公司的债务（包括税务债务）承担一定的责任。不过，在这种情况下，由于公司是主动联系税务机关进行更正申报，且误申报并非出于故意隐瞒或虚假申报的目的，因此股东或实际控制人通常不会因此承担额外的法律责任。但具体责任还需根据公司的注销程序、债务清偿情况以及相关法律法规的规定来确定。
四、总结与提醒
- 公司注销后发现误申报员工工资并主动联系税务及时更正申报，一般情况下不会承担严重的法律责任。但仍需根据具体情况配合税务机关的调查和处理，并可能面临一定的行政责任或补缴税款及滞纳金等后果。因此，建议公司在日常经营中加强财务和税务申报的内部管理和审核，确保申报的准确性和及时性。如果遇到相关法律问题，可以直接向我咨询。