县级农业农村局虽无直接行政强制权，但可通过法定程序对违法工具进行处理，具体方式如下：

一、依法申请法院强制执行

1. 法律依据：根据《中华人民共和国行政强制法》的相关规定，行政机关作出行政决定后，当事人在法定期限内不申请行政复议或者提起行政诉讼，又不履行的，没有行政强制执行权的行政机关可以自期限届满之日起三个月内，依照规定申请人民法院强制执行。

2. 操作流程：

   • 县级农业农村局在作出行政处罚决定后，应明确告知当事人申请行政复议或提起行政诉讼的期限。
   • 若当事人在法定期限内既不申请行政复议，也不提起行政诉讼，且不履行处罚决定，县级农业农村局可依法向有管辖权的人民法院申请强制执行。
   • 法院审查后，若认为申请合法，将裁定准予执行，并由法院负责执行相关违法工具的查封、扣押、拍卖等措施。

二、与相关部门协作处理

1. 协作机制：县级农业农村局可与当地公安、市场监管等部门建立协作机制，共同打击农业违法行为。

2. 协作方式：

   • 在发现违法工具时，县级农业农村局可及时通知相关部门，共同进行现场查处。
   • 若违法工具涉及刑事犯罪（如非法捕捞、销售禁用农资等），县级农业农村局应将案件移送公安机关，由公安机关依法进行刑事侦查和强制措施。
   • 对于需要查封、扣押的违法工具，县级农业农村局可请求相关部门协助执行，确保处理措施得到有效实施。

三、依法采取其他合法措施

1. 证据保全：在查处违法行为过程中，县级农业农村局可依法对违法工具进行证据保全，如拍照、录像、封存等，以固定证据，为后续处理提供依据。

2. 责令改正：对于违法行为情节较轻，尚不构成犯罪或不需要采取强制措施的，县级农业农村局可依法责令当事人改正违法行为，并可处以罚款等行政处罚。在责令改正过程中，可要求当事人自行处理违法工具，如销毁、返还等。

3. 公开通报：对于严重违法行为或拒不改正的当事人，县级农业农村局可依法将其违法行为及处理结果向社会公开通报，以起到警示作用，并可能影响其社会信用评价。

法律建议：

• 县级农业农村局在处理违法工具时，应严格遵守法定程序，确保处理措施的合法性和有效性。
• 加强与相关部门的沟通协作，形成打击农业违法行为的合力。
• 注重证据收集和保全工作，为后续处理提供有力支持。

后续行动指引：

• 若您在处理违法工具过程中遇到具体问题或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。