结论前置：合同上没有写扣工资百分之二十但被扣了，这通常是不合理的，但具体还需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定优先原则：

   • 根据一般的合同法和劳动法原则，用人单位与劳动者之间的权利和义务应当通过劳动合同来明确约定。如果劳动合同中没有明确约定用人单位可以扣除劳动者工资的百分之二十，那么用人单位擅自扣除的行为就缺乏合同依据，是不合理的。

2. 法定扣除情形：

   • 当然，也存在一些法定的扣除工资的情形，比如因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但即使在这种情况下，扣除的部分也不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。不过，这依然需要劳动合同中有相关约定或者法律法规有明确规定作为前提。若合同中无此约定，用人单位单方面扣除仍属不当。

3. 用人单位规章制度：

   • 有些用人单位可能会通过内部规章制度来规定工资的扣除方式。然而，这些规章制度必须符合法律法规的规定，并且需要经过民主程序制定，同时告知劳动者。如果规章制度中的扣除条款违反了法律法规或者没有经过合法程序制定和告知，那么这些条款对劳动者是不具有约束力的。因此，即使规章制度中有扣除工资的规定，也需要审查其合法性和有效性。

4. 实际操作建议：

   • 如果你遇到了这种情况，首先应当查看自己的劳动合同和用人单位的规章制度，确认是否有关于扣除工资的约定或规定。
   • 如果没有相关约定或规定，或者约定/规定不合法、无效，你可以与用人单位进行沟通协商，要求其停止不当扣除并补发被扣除的工资。
   • 如果沟通协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

举例说明：假设你的月工资是5000元，用人单位未经你同意擅自扣除了1000元（即20%）。如果劳动合同中没有相关约定，且用人单位的规章制度也没有合法有效的扣除条款，那么这种扣除就是不合法的。你有权要求用人单位补发这1000元工资，并可以通过法律途径来维护自己的权益。

后续行动建议：如果你对用人单位的扣除行为有疑问或者不满，建议先收集好相关证据（如工资条、劳动合同、规章制度等），然后咨询专业律师（即向我咨询）或者向当地的劳动监察部门寻求帮助。