工伤申请赔偿并不完全是由公司赔偿，而是根据具体情况，可能涉及工伤保险基金和用人单位的共同赔偿。以下是对这一问题的详细解释：
一、工伤保险基金赔偿部分
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。这部分费用，包括治疗工伤的医疗费用、康复费用、住院伙食补助费、到统筹地区以外就医的交通食宿费等，通常是由工伤保险基金来支付的。此外，如果职工因工致残被鉴定为一级至十级伤残，还可以从工伤保险基金中按月支付伤残津贴，以及一次性伤残补助金等。
二、用人单位赔偿部分
虽然工伤保险基金承担了大部分的工伤赔偿费用，但用人单位也并非完全无责。在以下情况下，用人单位需要承担赔偿责任：
停工留薪期工资：职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
护理费：生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。如果用人单位未派人护理，则需要支付护理费。
一次性伤残就业补助金：对于五级至十级伤残的职工，在与用人单位解除或者终止劳动合同时，用人单位需要支付一次性伤残就业补助金。
未依法缴纳工伤保险费的赔偿责任：如果用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，那么职工发生工伤的，所有工伤保险待遇项目费用均由用人单位自行支付。
三、特殊情况下的赔偿责任
在某些特殊情况下，如用人单位存在过错导致工伤事故发生，或者用人单位未按照法律规定为职工提供必要的劳动保护条件等，用人单位可能需要承担更重的赔偿责任。这包括但不限于支付额外的医疗费用、赔偿因工伤导致的收入损失等。
四、建议与行动
及时申请工伤认定：如果发生工伤事故，职工或其近亲属应及时向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
了解赔偿项目与标准：在申请工伤赔偿前，建议职工或其近亲属详细了解工伤保险待遇的项目和标准，以便更好地维护自己的合法权益。
与用人单位协商或寻求法律援助：如果与用人单位在工伤赔偿问题上存在争议，可以尝试与用人单位协商解决；如果协商无果，可以寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
作为马长孝律师，我专注于劳动工伤领域，如果你在工伤鉴定和赔偿方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。