结论：工厂搬迁员工不愿意去，是否能结清所有工资（这里假设“工程”为“工资”的误写，因为“工程”一般不用于描述员工应得款项，而工资是员工劳动的直接回报），需分情况讨论，主要取决于劳动合同的约定、搬迁的性质以及员工是否愿意解除劳动合同等因素。
分析：
劳动合同的约定：
- 如果劳动合同中明确规定了工作地点，且工厂搬迁导致工作地点发生重大变化，员工有权拒绝前往新地点工作。
- 在此情况下，如果员工选择解除劳动合同，根据《劳动合同法》的相关规定，工厂应当支付员工经济补偿，并结清所有工资。经济补偿的标准通常按照员工在工厂的工作年限和月工资来计算。
搬迁的性质：
- 如果工厂搬迁属于公司正常经营活动的调整，且搬迁后的工作地点并未超出劳动合同约定的范围，或者虽然超出了但员工同意前往，则员工应继续履行劳动合同，工厂无需因此结清所有工资。
- 如果工厂搬迁导致劳动合同无法继续履行（如搬迁至外地，员工无法接受），且双方无法就变更劳动合同达成一致，员工可以选择解除劳动合同，并要求工厂支付经济补偿和结清工资。
员工的选择：
- 如果员工不愿意前往新地点工作，且选择解除劳动合同，工厂应当按照法律规定支付经济补偿和结清工资。
- 如果员工不愿意前往新地点工作，但选择继续留在原工厂（如果可能的话），或者等待工厂安排其他工作，则工厂无需立即结清所有工资，但应确保员工的工资不受影响。
法律建议：
对于员工：
- 首先查看劳动合同中关于工作地点的约定，以及工厂搬迁是否违反了这一约定。
- 如果工厂搬迁导致劳动合同无法继续履行，且双方无法就变更劳动合同达成一致，可以考虑解除劳动合同，并要求工厂支付经济补偿和结清工资。
- 在与工厂协商时，保留好相关证据，如劳动合同、工资单、搬迁通知等，以便在需要时维护自己的合法权益。
对于工厂：
- 在搬迁前，应充分考虑员工的利益，与员工进行充分沟通，尽量达成一致意见。
- 如果搬迁导致部分员工无法继续履行劳动合同，应按照法律规定支付经济补偿和结清工资，以避免法律纠纷。
可能后果：
- 如果工厂未按照法律规定支付经济补偿和结清工资，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求工厂履行支付义务。
- 如果仲裁结果对工厂不利，工厂还需承担仲裁费用，并可能面临更严重的法律后果，如被强制执行、影响企业信誉等。
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