结论：发工资后两个月提出异议是否合法，需根据具体情况判断，主要取决于异议的内容和提出异议的法律依据。
分析：
工资支付异议的时效性：
- 一般来说，劳动者对工资支付有异议，应当在收到工资后及时提出。但法律并未明确规定一个具体的“异议期”，即并未明确规定必须在收到工资后的多少天内提出异议才合法。
- 然而，从实际操作和证据保存的角度来看，劳动者应尽快提出异议，以便及时解决问题并保留相关证据。如果拖延过久，可能会因证据灭失或对方不认可而增加维权难度。
异议内容的合法性：
- 劳动者提出的异议必须基于合法的事实和理由。例如，如果劳动者认为工资计算错误、未支付加班费、未依法缴纳社会保险费等，这些异议都是合法的。
- 如果劳动者提出的异议缺乏事实依据或法律依据，或者属于无理取闹，那么这种异议可能不被法律所支持。
提出异议的途径和方式：
- 劳动者可以通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等途径来提出异议。
- 在提出异议时，劳动者应尽可能提供充分的证据来支持自己的主张，如工资条、考勤记录、劳动合同等。
特殊情况下的异议提出：
- 如果劳动者在收到工资后两个月内因特殊原因（如生病、出差等）无法及时提出异议，且这种原因是可以被理解的，那么劳动者在特殊情况消除后仍可以提出异议。但此时，劳动者需要承担更多的举证责任，证明自己确实因特殊原因无法及时提出异议。
法律建议：
- 及时提出异议：劳动者在收到工资后，如果发现有任何问题或异议，应尽快与用人单位沟通并提出。这有助于及时解决问题，避免矛盾升级。
- 保留证据：在提出异议时，劳动者应保留好相关证据，如工资条、考勤记录、劳动合同等。这些证据在后续的维权过程中将起到关键作用。
- 寻求法律帮助：如果劳动者与用人单位无法就工资支付问题达成一致，或者用人单位拒绝回应劳动者的异议，劳动者可以寻求法律帮助，如向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
可能后果：
- 如果劳动者提出的异议合法且有充分证据支持，用人单位可能需要补发工资、支付加班费或承担其他法律责任。
- 如果劳动者提出的异议缺乏事实依据或法律依据，或者劳动者无法提供充分证据来支持自己的主张，那么劳动者的异议可能不被法律所支持，甚至可能需要承担一定的法律责任（如因恶意投诉而给用人单位造成损失的赔偿责任）。
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