结论：雇的司机将运费拿走是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断，主要包括车辆营运性质、双方约定以及运费性质等因素。以下从不同角度进行分析：
一、车辆营运性质与运费归属
若车辆为非营运性质：
- 如果个人车辆并非用于营运，而是偶尔用于自用或帮助他人运送少量货物，且不以营利为目的，那么司机拿走运费可能并不直接构成违法。但这种情况较为特殊，且通常运费金额较小，双方可能基于友好关系或互助原则进行，不涉及法律纠纷。
若车辆为营运性质：
- 如果车辆已办理道路运输经营许可证，且司机受雇于车主从事货物运输活动，那么运费通常应归车主所有。司机作为雇员，其职责是按照车主的指示完成运输任务，并领取相应的劳动报酬（如工资或提成），而非直接拿走运费。
- 若司机擅自拿走运费，可能构成对车主财产权的侵犯，车主有权要求司机返还运费，并可能根据双方签订的雇佣合同或相关法律规定追究司机的法律责任。
二、双方约定与运费归属
- 雇佣合同或协议：如果车主与司机之间签订了雇佣合同或协议，并明确约定了运费的归属和支付方式，那么双方应严格按照合同或协议执行。
- 若合同或协议中明确运费归车主所有，司机擅自拿走运费则构成违约，车主有权要求司机返还运费并承担违约责任。
- 若合同或协议中允许司机收取运费（如提成制），则司机拿走运费可能并不违法，但需确保符合合同或协议的约定。
三、运费性质与法律后果
运费作为劳动报酬：
- 如果运费被视为司机的劳动报酬（如提成），且双方对此有明确约定，那么司机拿走运费可能并不违法。但需注意，这种情况下运费通常应作为司机工资的一部分进行申报和纳税。
运费作为车主财产：
- 如果运费被视为车主的财产，司机擅自拿走则可能构成盗窃或侵占等违法行为。车主有权向公安机关报案，要求追究司机的刑事责任或民事责任。
四、建议与措施
- 明确约定：车主在雇佣司机时，应签订明确的雇佣合同或协议，详细约定运费的归属、支付方式以及违约责任等条款，以避免后续纠纷。
- 加强管理：车主应加强对司机的管理，确保司机按照合同或协议的约定履行职责，并定期对运费进行核对和结算。
- 法律维权：如果司机擅自拿走运费且拒不返还，车主应及时收集证据（如合同、运输记录、运费收据等），并向公安机关报案或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
总结：雇的司机将运费拿走是否违法，需根据车辆营运性质、双方约定以及运费性质等因素综合判断。车主在雇佣司机时，应签订明确的合同或协议，并加强管理以避免纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。