针对您提出的“运费被司机拿跑了怎么办”的问题，我理解您是遇到了运输过程中运费被司机非法占有的情况。以下是我从多个角度为您分析并给出的建议：
法律关系分析：
- 在运输合同中，司机作为承运人，有义务按照约定将货物安全送达目的地，并收取合理的运费。若司机在完成运输任务后，非法占有运费，则可能构成违约或侵占等违法行为。
应对措施：
- 收集证据：首先，您需要收集所有与运输合同相关的证据，包括合同文本、运输单据、付款记录、沟通记录等。这些证据将有助于您证明司机确实非法占有了运费。
- 与司机协商：在证据充分的情况下，您可以尝试与司机进行协商，要求其归还非法占有的运费。协商过程中，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和依据。
- 寻求法律援助：若协商无果，您可以考虑寻求法律援助。您可以向当地公安机关报案，说明司机非法占有运费的情况，并提供相关证据。公安机关将依法进行调查处理。同时，您也可以咨询专业律师，了解您的法律权益和可能的维权途径。
- 提起诉讼：在证据充分且协商、报案均无果的情况下，您可以考虑向法院提起诉讼，要求司机归还非法占有的运费，并可能要求其承担违约责任或赔偿损失。
预防措施：
- 完善合同条款：在未来的运输合同中，明确约定运费的支付方式、时间和条件，以及违约责任和争议解决方式等条款。这有助于减少类似纠纷的发生。
- 选择信誉良好的承运人：在选择司机或运输公司时，尽量选择信誉良好、口碑可靠的承运人。这可以通过查询相关资质、了解过往业绩和客户评价等方式进行。
- 加强监管和沟通：在运输过程中，加强与司机的沟通和监管，确保货物安全送达目的地，并及时支付运费。这有助于及时发现和解决问题，避免纠纷升级。
法律后果：
- 若司机被认定非法占有运费，其可能面临民事赔偿责任，即需要归还非法占有的运费，并可能承担因违约或侵权行为造成的其他损失。
- 在严重情况下，司机还可能面临刑事责任，如侵占罪等。这取决于非法占有的运费数额、情节严重程度以及当地法律法规的规定。
针对您的情况，我建议您首先收集相关证据，然后与司机进行协商。若协商无果，您可以考虑寻求法律援助或提起诉讼。同时，为了预防类似纠纷的发生，您可以在未来的运输合同中完善相关条款，并选择信誉良好的承运人。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。