结论：工程施工中乙方开具13%税率的发票，甲方是否能够接受，这主要取决于双方合同中的约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果双方在合同中明确约定了乙方应开具的发票税率，且该税率与乙方实际开具的13%税率相符，那么甲方接受该发票是符合合同约定的。
   • 如果合同中未明确约定发票税率，但双方在实际履行过程中，乙方按照13%的税率开具发票，且甲方未提出异议，那么可以视为双方对发票税率达成了新的合意，甲方接受该发票也是合理的。
   • 如果合同中约定的税率与乙方实际开具的13%税率不符，且双方未就税率变更达成一致意见，那么甲方有权拒绝接受该发票，并要求乙方按照合同约定的税率重新开具。

2. 法律法规角度：

   • 根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及相关规定，增值税税率是由国家规定的，不同商品或服务的税率可能不同。在工程施工领域，如果乙方提供的服务属于应税服务，且税率为13%，那么乙方开具13%税率的发票是合法的。
   • 甲方作为发票的接收方，有义务对发票的真实性、合法性和有效性进行审核。如果乙方开具的发票符合法律法规的规定，且甲方能够确认其真实性，那么甲方接受该发票是合法的。
   • 如果乙方开具的发票存在虚假、伪造或不符合法律法规规定的情况，甲方不仅有权拒绝接受该发票，还有权向相关部门举报乙方的违法行为。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，甲方在接受乙方开具的发票时，应仔细核对发票上的信息，包括发票号码、开票日期、购买方和销售方的名称、纳税人识别号、服务名称、税率和金额等，确保发票的真实性和合法性。
   • 如果甲方对乙方开具的发票存在疑问或不确定其是否合法，可以要求乙方提供相关的证明材料或咨询专业的税务机构或律师进行确认。

建议：

• 为了避免因发票税率问题产生的纠纷，双方在签订合同时应明确约定发票的税率和开具方式。
• 在实际履行过程中，双方应保持良好的沟通，及时就发票税率等事项进行协商和确认。
• 如果甲方对乙方开具的发票存在疑问或不确定其是否合法，应及时咨询专业的税务机构或律师进行确认和处理。

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