针对您提出的“乙方不能开发票甲方可以开吗合法吗”这一问题，以下是我的详细解答：
一、明确结论
在常规情况下，如果乙方为甲方提供了服务，那么应当由乙方作为服务提供方来开具发票给甲方。若由甲方（非实际服务提供方）来开具发票，这通常是不符合法律规定的，并可能构成虚开发票的行为，存在较大的法律风险。但在某些特定且合法的情况下，如存在明确的委托代理关系或特殊税收政策允许时，可能会有例外。
二、详细分析
发票管理规定：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》，发票的开具应当如实反映实际经营业务情况。这意味着，发票的开具方应当是实际提供服务或销售商品的一方。
- 如果甲方并非实际服务提供方却开具了发票，这将构成虚开发票行为，可能面临税务机关的处罚，包括没收违法所得、罚款，甚至在情节严重的情况下承担刑事责任。
合同法原则：
- 在合同关系中，双方应当直接履行各自的义务。乙方作为服务提供方，有义务向甲方开具发票以证明服务的提供和费用的收取。
- 甲方作为服务的接收方，其义务是支付费用并接收发票，而非开具发票。
特定情况下的例外：
- 在某些特定情况下，如存在明确的委托代理关系，且合同中有明确条款规定由第三方（如甲方受乙方委托）开具发票，且这种安排符合当地税收政策和法律法规，那么可能是合法合规的。但这种情况非常特殊，且需要严格的法律和税务审查。
- 另外，某些特定的税收优惠政策或特殊规定可能允许在特定条件下由第三方开具发票，但这同样需要依据具体政策并满足相应条件。
三、合规建议
避免非实际服务提供方开票：
- 在商业合作中，应尽量避免由非实际服务提供方（如甲方）开具发票的情况，以减少交易的复杂性和法律风险。
咨询专业人士：
- 如果确实存在由非实际服务提供方开票的需求或疑问，建议咨询当地税务局或相关法律专业人士，以确保操作的合法性和合规性。
申请代开发票：
- 如果乙方无法自行开具发票，可以到税务机关申请代开发票。这是合法且常见的做法，可以确保发票的开具符合实际业务情况和法律规定。
审查合同条款：
- 在签订合同时，应仔细审查合同条款，确保发票开具方与实际服务提供方一致。这可以避免后续的法律纠纷和税务问题。
综上所述，对于您提出的问题，一般情况下应由乙方作为服务提供方开具发票给甲方。在特定且合法的情况下可能存在例外，但这种情况非常特殊且需要严格的法律和税务审查。因此，在商业合作中应谨慎处理发票开具问题，并确保操作的合法性和合规性。