结论：工资除以31天来计算日工资，在一般情况下并不直接涉及违法性，但关键在于这种计算方式是否符合劳动合同的约定以及是否保障了劳动者的合法权益。同时，一天上班12小时可能涉及加班问题，需要按照法律规定支付加班费。

详细分析：

1. 日工资的计算方式：

   • 日工资的计算通常基于月工资和月计薪天数。根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，月计薪天数为21.75天，这是基于全年365天减去104天休息日（每周2天，共52周）再除以12个月得出的。但实际操作中，有些单位可能会采用30天或31天作为月计薪天数来计算日工资，这本身并不直接违法，关键在于劳动合同或单位规章制度中是否有明确约定，并且这种约定是否公平合理，没有损害劳动者的权益。
   • 如果劳动合同或单位规章制度中明确规定了按照31天计算日工资，且这种计算方式没有低于当地最低工资标准，也没有损害劳动者的其他合法权益，那么这种计算方式是可以接受的。但需要注意的是，这种计算方式可能会导致劳动者在休息日或法定节假日不工作时，日工资的计算基数相对较高（因为分母较大），而在实际工作日时，如果按此方式折算的小时工资低于法定标准，则可能存在问题。

2. 一天上班12小时的问题：

   • 根据《劳动法》的规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果一天上班12小时，那么超出的4小时属于加班时间。
   • 加班时间的工资支付：根据《劳动法》第四十四条，工作日加班的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日加班又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定节假日加班的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
   • 因此，如果一天上班12小时，其中8小时为正常工作时间，超出的4小时应按照上述规定支付加班费。如果单位没有按照法律规定支付加班费，那么劳动者的权益就受到了侵害。

建议：

• 对于劳动者：如果发现单位在计算日工资或支付加班费方面存在问题，应及时与单位沟通协商，要求单位按照法律规定进行计算和支付。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于单位：应严格按照法律规定和劳动合同的约定来计算和支付劳动者的工资和加班费，避免因为计算方式不当或支付不足而引发劳动争议和法律风险。

示例计算（假设月工资为5000元，按照31天计算日工资，且一天上班12小时，其中4小时为加班）：

• 日工资 = 月工资 / 31 = 5000 / 31 ≈ 161.29元
• 正常工作时间的小时工资 = 日工资 / 8 = 161.29 / 8 ≈ 20.16元（此数值仅为示例，实际应依据劳动合同或单位规章制度确定）
• 加班费 = 加班小时数 × 正常工作时间的小时工资 × 加班费倍数 = 4 × 20.16 × 1.5（工作日加班） = 120.96元（此计算基于假设的小时工资，实际应依据法定标准或劳动合同约定）

请注意，上述计算中的小时工资仅为示例，实际计算时应依据劳动合同或单位规章制度中约定的小时工资标准，或者按照月工资总额和月计薪天数（通常为21.75天）来折算小时工资。如果单位没有约定小时工资标准，且按照31天计算日工资导致小时工资低于法定标准，那么应以法定标准为准来计算加班费。有问题可以直接向我咨询。