结论：公司上半个月班发半个月工资是否合法，需根据具体情况判断，包括劳动合同的约定、公司规章制度以及实际工作情况等。
分析说明：
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定劳动报酬、工作时间等关键条款。如果劳动合同中明确规定了按照实际工作天数计算工资，且双方均同意并签署了该合同，那么公司上半个月班发半个月工资是合法的。
公司规章制度：
- 除了劳动合同，公司的规章制度也是判断工资发放合法性的重要依据。如果公司规章制度中明确规定了工资的计算方式和发放周期，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，同时员工在入职时已经知晓并同意这些规定，那么公司按照规章制度发放工资也是合法的。
实际工作情况：
- 如果员工确实只工作了半个月，且没有违反公司规章制度或劳动合同中的任何条款，那么公司按照实际工作天数发放工资是合理的。然而，如果员工已经完成了整个月的工作任务，但公司却只发放半个月的工资，这显然是不合法的，员工有权要求公司补发剩余的工资。
特殊情况：
- 还需要考虑一些特殊情况，如员工请假、旷工等。如果员工因为个人原因请假或旷工导致实际工作天数减少，公司按照实际工作天数发放工资是合理的。但是，公司必须确保请假或旷工的记录准确无误，并且已经按照公司规章制度或劳动合同中的规定进行了处理。
法律建议：
对于员工：如果你认为公司发放的工资不合法或不合理，首先应当查看劳动合同和公司规章制度中关于工资发放的规定。如果发现公司存在违法行为，可以与公司进行协商，要求补发工资或调整工资发放方式。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于公司：公司应当确保工资发放的合法性和合理性，遵守相关法律法规和劳动合同、公司规章制度的规定。在发放工资时，应当准确记录员工的工作天数和工资计算方式，避免出现纠纷。如果员工对工资发放有异议，公司应当积极与员工进行沟通协商，寻求解决方案。
可能后果：
- 如果公司违法发放工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。同时，公司还可能因为违法行为而损害员工的权益，导致员工流失、声誉受损等不良后果。因此，公司应当严格遵守相关法律法规和劳动合同、公司规章制度的规定，确保工资发放的合法性和合理性。