在申请公司军工资质时，涉密人员需要查询的是无犯罪信息，而非违法犯罪信息。以下是对这一问题的详细分析：

一、军工资质申请与涉密人员要求

军工资质申请是一个严格且复杂的过程，其中涉密人员的选拔和管理是至关重要的一环。涉密人员因其接触到的信息具有高度的敏感性和保密性，因此必须满足一系列严格的要求，以确保国家秘密的安全。

二、无犯罪信息查询的必要性

1. 法律合规性：根据相关法律法规，涉密人员必须具备良好的政治素质和道德品质，无违法犯罪记录是其中的重要一项。查询无犯罪信息是确保涉密人员符合这一要求的有效手段。
2. 国家安全考虑：军工资质涉及国家安全和军事秘密，涉密人员的背景必须清白，无任何可能危害国家安全的犯罪记录。这是维护国家安全和稳定的重要措施。
3. 企业信誉与资质：对于申请军工资质的企业而言，拥有无犯罪记录的涉密人员团队也是提升企业信誉和资质的重要因素。这有助于企业在激烈的市场竞争中脱颖而出，获得更多的合作机会。

三、违法犯罪信息与无犯罪信息的区别

• 违法犯罪信息：通常指的是个人因违反法律、法规而受到的处罚或判决记录，包括但不限于刑事犯罪、行政处罚等。这些信息反映了个人过去的违法犯罪行为。
• 无犯罪信息：则是指个人在特定时间段内（如过去几年内）没有违法犯罪记录的证明。这是涉密人员选拔中更为关注的信息点，因为它直接关联到个人的当前状态和未来可能的行为倾向。

四、实际操作建议

1. 明确查询要求：在申请军工资质时，企业应明确涉密人员需要提供无犯罪信息证明，并了解具体的查询流程和要求。
2. 选择正规渠道：涉密人员应通过正规渠道（如公安机关）查询并获取无犯罪信息证明，以确保信息的真实性和有效性。
3. 加强背景审查：除了无犯罪信息证明外，企业还应对涉密人员进行全面的背景审查，包括政治素质、道德品质、工作经历等方面，以确保其符合涉密人员的要求。

五、可能面临的法律后果

如果涉密人员存在违法犯罪记录而未被查出，一旦被发现，不仅涉密人员本人可能面临法律责任，企业也可能因管理不善而承担相应的法律责任。这包括但不限于行政处罚、资质吊销等严重后果。

综上所述，在申请公司军工资质时，涉密人员需要查询的是无犯罪信息。这是确保国家秘密安全、维护企业信誉和资质的重要措施。如果你在军工资质申请或涉密人员管理方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。