结论：一方发函保留诉讼时效的行为，并不影响对方同时享有诉讼时效的权利。诉讼时效是法律规定的权利行使期限，双方各自独立计算，互不干扰。

详细解释：

1. 诉讼时效的基本概念：

   • 诉讼时效，是指权利人在法定期间内不行使权利，即丧失请求法院依法保护其民事权利的法律制度。它是对权利人行使权利的一种限制，旨在促使权利人及时行使权利，避免法律关系的长期不确定状态。

2. 一方发函保留诉讼时效的含义：

   • 当一方（如债权人）担心其权利可能因诉讼时效届满而得不到法律保护时，可能会通过发函的方式向对方（如债务人）主张权利，以此中断诉讼时效的计算，从而保留其通过法律途径追索权利的可能性。这种行为在法律上被称为“诉讼时效中断”。

3. 对方诉讼时效的独立性：

   • 诉讼时效是针对每个权利人独立计算的。一方发函保留其诉讼时效，并不意味着对方的诉讼时效因此受到影响或改变。对方仍然享有其法律规定的诉讼时效期间，可以在该期间内行使自己的权利或提出抗辩。

4. 双方诉讼时效的并行性：

   • 在合同纠纷中，双方可能各自拥有不同的权利，并因此享有不同的诉讼时效。例如，债权人可能享有要求债务人履行债务的诉讼时效，而债务人可能享有要求债权人履行其他义务（如提供发票、确认收款等）的诉讼时效。这些诉讼时效是并行存在的，互不干扰。

5. 实际操作中的建议：

   • 对于合同双方而言，应密切关注各自权利的诉讼时效期间，及时行使权利或提出抗辩。
   • 如果一方担心诉讼时效届满，可以通过发函、提起诉讼等方式中断诉讼时效的计算。
   • 同时，双方也应保留好相关证据，以备在诉讼或仲裁中证明自己的主张。

举例说明： 假设甲与乙签订了一份买卖合同，约定甲向乙出售货物，乙支付货款。合同履行过程中，甲担心乙未按时支付货款会导致其债权诉讼时效届满，于是向乙发函催款。这一行为中断了甲对乙的债权诉讼时效的计算。然而，这并不影响乙对甲可能享有的其他权利（如要求甲提供发票、确认收款等）的诉讼时效。乙仍然可以在其诉讼时效期间内行使这些权利。

进一步思考： 在实际操作中，诉讼时效的计算和中断可能涉及复杂的法律问题和事实认定。因此，如果双方对诉讼时效有争议或不确定如何计算，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见。同时，双方也应加强合同管理，明确约定权利义务和履行期限，以减少因诉讼时效问题引发的纠纷。