公司个税只给报底薪是不合法的。以下从几个方面为你详细分析：
法律背景
根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，个人所得税的计税依据是纳税人的综合所得，这包括工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得等。在工资、薪金所得方面，它涵盖了个人因任职或者受雇而取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得。因此，公司申报个税时，应将员工的全部工资性收入纳入计税范围，而不仅仅是底薪。
公司的义务
公司作为个人所得税的扣缴义务人，有责任按照法律规定准确计算和申报员工的应纳税所得额。如果公司只给报底薪，而忽略了其他工资性收入，如奖金、津贴、补贴等，那么这种行为就构成了未如实申报个税的违法行为。这不仅损害了员工的合法权益，也可能使公司面临税务机关的处罚。
可能的法律后果
对员工的影响：如果公司只给报底薪，员工在个税申报上的收入就会低于实际收入，这可能导致员工在退休、购房、购车等方面享受的税收优惠政策受到影响。同时，如果员工未来需要补缴个税，还可能面临滞纳金和罚款等额外负担。
对公司的影响：公司未如实申报个税，可能面临税务机关的处罚，包括罚款、滞纳金等。此外，公司的信誉和形象也可能因此受损，影响公司的长期发展。
建议
员工方面：如果你发现公司只给报底薪，而忽略了其他工资性收入，你可以与公司沟通，要求公司如实申报个税。如果公司拒绝改正，你可以向当地税务机关举报，维护自己的合法权益。
公司方面：作为公司，应该严格遵守税法规定，如实申报员工的个税。如果公司对税法规定不了解或存在疑问，可以咨询专业的税务机构或律师，确保公司的税务合规。
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