若公司转让后，您已经申请了劳动仲裁，不必过于担心，仲裁程序会继续进行，但需要注意一些关键点：

1. 仲裁程序不受影响：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关规定，劳动仲裁程序一旦启动，不会因为公司的转让而自动终止或失效。仲裁庭会继续审理案件，并作出裁决。

2. 转让后的责任承担：

   • 如果公司转让后，新的主体（受让方）承接了原公司的权利和义务，包括劳动关系的继续履行和劳动争议的解决，那么仲裁裁决将对新的主体具有约束力。
   • 如果转让过程中，原公司和新公司之间有明确的约定，关于劳动争议的责任承担，这可能会影响仲裁裁决的执行。但这种约定通常不能对抗劳动者，除非劳动者明确同意。

3. 仲裁中的主体变更：

   • 在仲裁过程中，如果发现公司已经转让，且新的主体与案件有直接利害关系，您可以向仲裁庭申请变更被申请人，将新的主体列为仲裁的当事人。
   • 仲裁庭会根据实际情况，决定是否同意变更被申请人，并通知相关当事人。

4. 仲裁裁决的执行：

   • 一旦仲裁裁决作出，如果公司（或新的主体）不履行裁决义务，您可以向人民法院申请强制执行。
   • 在执行过程中，如果公司已经转让，且新的主体承接了原公司的资产和债务，那么新的主体可能成为执行的对象。

5. 建议与注意事项：

   • 及时收集证据：在公司转让过程中，及时收集和保存与劳动关系、工资支付、工伤赔偿等相关的证据，以备仲裁和诉讼之需。
   • 关注转让动态：密切关注公司的转让动态，包括转让协议的内容、新公司的资质和信誉等，以便及时采取应对措施。
   • 咨询专业律师：如果您对公司转让后的仲裁程序、责任承担等方面有疑问或担忧，建议及时咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。

行动建议：

• 继续参与仲裁程序，按照仲裁庭的要求提交证据和陈述意见。
• 如果发现公司转让且可能影响仲裁结果，及时向仲裁庭申请变更被申请人。
• 密切关注仲裁裁决的执行情况，如果公司不履行裁决义务，及时向人民法院申请强制执行。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。