用人单位在此情况下主要面临以下法律风险：

1. 未依法缴纳社会保险的法律责任
   根据《社会保险法》第五十八条，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。若用人单位虽签订劳动合同但未将员工社保转入，可能被认定为未依法缴纳社会保险，面临以下后果：
   

• 行政处罚：社保征收机构可责令限期缴纳或补足，并自欠缴之日起按日加收万分之五的滞纳金（《社会保险法》第八十六条）；逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。
  
• 员工索赔风险：员工可依据《劳动合同法》第三十八条以“未依法缴纳社会保险”为由解除劳动合同，并主张经济补偿金（按工作年限，每满一年支付一个月工资）。
  
• 工伤赔偿风险：若员工发生工伤，因未缴纳工伤保险，用人单位需承担全部工伤保险待遇（如医疗费、伤残补助金等），可能面临高额赔偿。

1. 劳动关系认定争议风险
   若社保未转入且存在其他公司代缴社保的情况，可能引发以下争议：
   

• 劳动关系混淆：员工可能主张与实际用工单位（而非社保缴纳单位）存在劳动关系，用人单位需举证证明劳动关系归属（如劳动合同、工资发放记录、考勤记录等）。若举证不足，可能被认定存在事实劳动关系，需承担未签劳动合同的双倍工资差额等责任。
  
• 社保缴纳主体与用工主体不一致：若员工以社保缴纳单位为被告主张权益（如工伤赔偿），社保缴纳单位可能以“非实际用工主体”抗辩，导致员工转向实际用工单位索赔，增加用人单位诉讼风险。

1. 税务合规风险
   若用人单位通过其他公司代缴社保，可能涉及以下税务问题：
   

• 个税申报风险：用人单位需按工资薪金总额代扣代缴个人所得税。若社保未转入但工资由用人单位发放，可能因社保缴费基数与工资总额不一致引发税务稽查，被要求补缴税款及滞纳金。
  
• 虚开发票风险：若其他公司以“服务费”名义开具发票用于社保代缴，可能被认定为虚开发票，用人单位需承担连带责任。

建议措施：

1. 及时办理社保转入：用人单位应在用工之日起三十日内为员工办理社保登记，确保社保缴纳主体与用工主体一致。
   
2. 规范用工管理：完善劳动合同、工资发放、考勤等用工文件，明确劳动关系归属，避免证据缺失。
   
3. 避免代缴社保：若需通过第三方缴纳社保，应签订书面协议明确权利义务，并确保符合地方社保政策（如部分地区允许“社保代理”但需严格监管）。
   

如需进一步分析具体案例或地方政策，可直接向我咨询。