正式工没有做满三个月扣底薪一半是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律条款依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，无论劳动者工作时长如何，只要提供了劳动，用人单位就必须按时足额支付工资，扣底薪一半的行为明显违反了这一规定。
2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。此条款进一步强调了用人单位足额支付工资的义务，以及劳动者在工资被拖欠或未足额支付时的维权途径。
3. 《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条：除本法第二十二条和第二十三条规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。用人单位以未做满三个月为由扣减工资，实质上是一种变相的违约金要求，违反了法律规定。因为劳动者提前离职并不属于法律规定的可以约定违约金的情形。

具体分析

• 工资支付义务：劳动者与用人单位建立劳动关系后，劳动者提供劳动，用人单位就应当按照约定支付工资。工资是劳动者劳动的报酬，是劳动者及其家庭生活的主要来源。用人单位不得因劳动者未做满三个月就随意扣减工资，这是对劳动者基本权益的严重侵害。
• 辞职权利：劳动者享有依法解除劳动合同的权利。根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同；劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。这表明，劳动者并不需要工作满一定期限才能离职，只要按照法律规定的方式通知用人单位即可。
• 非法扣减工资的法律责任：如果用人单位违反法律规定，克扣劳动者工资，将承担相应的法律责任。根据《劳动保障监察条例》第二十六条规定，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。

维权途径

当遇到这种情况时，你可以通过以下途径维护自己的合法权益：

1. 协商：首先尝试与用人单位进行沟通协商，明确指出其扣工资的行为不合法，要求按照实际工作情况足额支付工资。在协商过程中，要注意保留好相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等。
2. 投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门将对用人单位的工资支付情况进行监督检查，并责令其改正违法行为。投诉时，你需要提供相关的证据材料，以便劳动监察部门进行调查处理。
3. 仲裁：你还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付被克扣的工资及相应的经济补偿。申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。在仲裁过程中，你需要提供充分的证据证明用人单位存在克扣工资的行为。
4. 诉讼：如果你对仲裁结果不满意，可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，寻求进一步的法律救济。

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