针对您提出的“员工6个月没上班公司交社保是否合法”的问题，这主要取决于员工与公司之间是否存在真实的劳动关系或是否有合法的特殊安排。以下是对此问题的详细解答：
一、合法情形
劳动关系存续但暂时离岗：
- 如果员工与公司之间的劳动关系依然存在，且员工因合法合理原因（如病假、产假、工伤停工留薪期等法定假期）暂时不上班，那么公司有义务继续为其缴纳社保。这是公司依法应尽的责任，旨在保障员工在特殊时期的社保权益。例如，女职工在产假期间，虽然未实际在公司工作，但与公司的劳动关系仍然存续，公司应当为其正常缴纳社保。
双方协商一致的特殊安排：
- 在某些情况下，员工与公司可能经过充分沟通并达成一致意见，公司出于自愿且基于合理理由继续为离职员工缴纳社保（费用一般由员工个人承担或双方按约定分担），并签订了相关协议明确权利义务。这种情况下，公司缴纳社保也是合法的。比如，员工离职后因新单位社保缴纳有时间衔接问题，原公司应员工要求在短期内继续帮忙缴纳社保，并签订了相关协议。
劳动关系已建立但未正式上班：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。这意味着，即使劳动者还未正式开始工作，但如果已经与用人单位签订了劳动合同或存在事实劳动关系，用人单位为其缴纳社会保险是合法的。
二、不合法情形
虚构劳动关系缴纳社保：
- 如果员工实际上已经与公司解除了劳动关系，不存在真实的劳动用工关系，但公司却为其缴纳社保（如为了帮助他人获取购房、购车资格或骗取社保待遇等），这种通过虚构劳动关系来缴纳社保的行为是违法的。一旦被社保部门查处，公司可能面临罚款等处罚；涉及骗取社保待遇的，还可能面临更严厉的法律制裁。
利用挂靠方式缴纳社保：
- 个人与公司不存在真实劳动关系，只是向公司支付一定费用，以公司名义缴纳社保的行为也是不合法的。这种行为扰乱了社保管理秩序，可能损害社保基金的安全。例如，个人为了享受职工社保待遇，找一家公司挂靠缴纳社保，这种行为是违法的。
三、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第七十二条：明确规定了用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。
- 《中华人民共和国社会保险法》第五十八条：要求用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
- 《中华人民共和国社会保险法》第八十四条：对用人单位不办理社会保险登记的行为设定了相应的法律责任，包括责令限期改正、罚款等。
四、结论与建议
综上所述，公司在员工6个月没上班的情况下为其缴纳社保的合法性取决于具体情况。如果存在真实劳动关系或合法协议，则公司缴纳社保是合法的；反之，则可能构成违法行为。因此，建议您先核实员工与公司之间的劳动关系状态以及是否存在合法协议，再据此判断公司缴纳社保的合法性。如果存在疑问或争议，建议咨询专业律师或当地社保部门以获取更准确的法律意见。