核心结论：员工辞职拿完工资但未办理离职手续，可能会产生一系列法律和实务上的影响，具体处理方式需根据实际情况判断。以下是详细分析：

1. 未办理离职手续的法律后果
   从法律层面看，离职手续是劳动关系终止的法定程序，包括工作交接、社保减员、档案转移等。若员工未办理离职手续，用人单位可能面临以下风险：

   • 劳动争议风险：员工可能以“未办理离职手续”为由主张劳动关系未解除，要求继续支付工资或补缴社保；
     
   • 经济损失风险：若员工未交接工作导致用人单位损失，用人单位可能需通过法律途径追偿，但举证难度较大；
     
   • 行政处罚风险：若未及时办理社保减员，用人单位可能被社保部门责令补缴或罚款。
     

2. 用人单位的应对措施
   若员工已离职但未办理手续，用人单位可采取以下步骤：

   • 书面催告：通过邮件、短信或书面通知要求员工限期办理离职手续，并保留催告证据；
     
   • 单方解除劳动关系声明：若员工拒不配合，用人单位可发布书面声明，明确劳动关系已因员工辞职而终止，并注明未办理手续的后果；
     
   • 暂停后续流程：在员工未完成交接前，可暂缓出具离职证明、暂停支付经济补偿（如有）或暂停办理档案转移，但需注意不得克扣已结算工资。
     

3. 员工的潜在风险
   对员工而言，未办理离职手续也可能带来不利后果：

   • 影响新就业：部分用人单位要求提供原单位离职证明，未办理手续可能导致入职受阻；
     
   • 社保断缴风险：若原单位未及时减员，新单位无法续缴社保，可能影响医保、养老等权益；
     
   • 信用记录风险：长期拒不配合办理手续可能被用人单位记录为“不诚信行为”，影响职业声誉。
     

4. 实务建议

   • 对用人单位：完善离职流程制度，明确未办理手续的后果（如扣除部分绩效、追究损失等），并在劳动合同或规章制度中约定；
     
   • 对员工：即使已拿工资，也应主动配合办理离职手续，避免后续纠纷。若用人单位拒不办理，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
     

总结：未办理离职手续可能对双方均产生不利影响，建议通过沟通或法律途径尽快解决。若您有具体细节需要进一步分析，可直接向我咨询。