在劳动合同上工资只写基础工资的情况下，赔偿时通常不会仅按基础工资来计算，而是会综合考虑实际工资收入情况。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律背景与原则

根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动合同应当明确约定劳动报酬，这包括基本工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。当劳动合同中仅约定了基础工资，而实际发放的工资高于基础工资时，赔偿计算应基于实际工资收入，而非仅限于基础工资。这是因为，劳动合同的约定应当真实反映双方的劳动关系和权利义务，如果实际发放的工资与合同约定不符，且劳动者能够证明这一点，那么赔偿计算应依据实际发放的工资。

二、赔偿计算的具体情况

1. 经济补偿金或赔偿金：

   • 在计算经济补偿金或赔偿金时，如果劳动合同中约定的工资低于实际发放的工资，劳动者有权要求按照实际工资收入来计算。这是因为经济补偿金或赔偿金的目的是对劳动者因劳动关系解除或终止而遭受的损失进行补偿，因此应当基于劳动者实际的经济损失来计算。
   • 计算公式（以经济补偿金为例）：经济补偿金 = 实际月平均工资 × 工作年限。其中，实际月平均工资应包括基础工资、奖金、津贴、补贴等各项收入。

2. 加班费、未休年假工资等：

   • 对于加班费、未休年假工资等，同样应当基于实际工资收入来计算。如果劳动合同中仅约定了基础工资，而实际发放的工资中包含了加班费、奖金等，那么在计算这些费用时，应当将实际发放的工资作为计算基数。

三、实际操作中的建议

1. 保留证据：

   • 劳动者应当保留好与工资收入相关的证据，如工资条、银行转账记录、奖金发放记录等。这些证据在发生劳动纠纷时，将作为证明实际工资收入的重要依据。

2. 与用人单位协商：

   • 在发生劳动纠纷时，劳动者可以首先尝试与用人单位进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果协商无果，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。

3. 寻求法律援助：

   • 如果劳动者在赔偿计算方面遇到困难或疑问，可以寻求专业的法律援助或咨询。作为专业律师，我可以根据劳动者的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助。

四、可能遇到的法律后果

如果用人单位在劳动合同中仅约定基础工资，而实际发放的工资高于基础工资，但在赔偿计算时却仅按基础工资来计算，这可能构成违法行为。劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位按照实际工资收入来计算赔偿。

综上所述，在劳动合同上工资只写基础工资的情况下，赔偿计算应基于实际工资收入情况。劳动者应当保留好相关证据，并在必要时寻求专业的法律援助或咨询。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。