在劳动赔偿中，赔偿的计算通常基于实际工资（应发工资），而非合同上写的工资，但具体还需根据赔偿情形和相关法律规定来确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、经济补偿金与赔偿金（涉及劳动关系解除或终止）
计算标准：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，且按照《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，该平均工资应按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入，即应发工资。
- 如果劳动合同约定的工资低于实际发放的工资，且用人单位长期按此执行，劳动者有权要求按照实际工资来计算经济补偿。
特殊情况：
- 劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
- 赔偿金为经济补偿金的二倍，适用于用人单位违法解除或终止劳动合同的情形，同样以实际工资为计算基础。
二、工伤赔偿
本人工资的概念及应用：
- 本人工资是指工伤职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月平均月缴费工资。这一标准可能与合同上约定的工资一致，也可能因用人单位的社保缴纳策略而有所不同。
- 在计算一次性伤残补助金、伤残津贴等赔偿项目时，若缴费工资与实际工资不一致，一般按实际工资（即应发工资）计算，但需注意上下限规定（即不得高于统筹地区职工平均工资的300%，也不得低于60%）。
其他赔偿项目：
- 一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金、丧葬补助金等赔偿项目的计算，可能会参考统筹地区上年度职工月平均工资，这一标准与合同工资无关。
- 停工留薪期工资的处理上，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需暂停工作接受治疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常指受伤前正常出勤的工资收入，可能包含绩效、奖金等，需结合实际情况确定，一般以受伤前12个月的平均工资来计算，即应发工资。
三、实际操作注意事项
证据保留：
- 劳动者应妥善保留能证明实际工资水平的证据，如工资条、银行流水、个税缴纳记录、与用人单位的沟通记录等。这些证据在劳动争议处理中将起到关键作用，有助于劳动者维护自己的合法权益。
用人单位的责任：
- 用人单位在签订劳动合同时应如实填写劳动报酬的数额或计算方法，避免给劳动者造成误解或损失。如用人单位故意在劳动合同中约定较低的工资标准以规避法律责任，劳动者有权向劳动行政部门举报或寻求法律途径解决争议。
举例说明：
假设小张与用人单位签订的劳动合同中约定的工资为每月2000元，但实际上用人单位每月向小张支付4000元工资。若小张因用人单位违法解除劳动合同而要求支付经济补偿，那么经济补偿的计算应基于小张实际获得的4000元工资，而非合同约定的2000元工资。
总结与建议：
在劳动赔偿中，赔偿的计算通常基于实际工资（应发工资）。劳动者应了解自己的权益，确保在面临劳动合同解除或终止、工伤等情况时能够获得与其实际贡献和应得收入相符的赔偿。同时，劳动者应保留好相关证据以维护自己的权益。如果您在劳动赔偿方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。