赔偿金的计算基数一般应按照应发工资来确定，但在特定情形下也可能考虑实际工资或合同工资。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与一般原则
《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：
- 劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
- 劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。
二、不同情形的具体分析
经济补偿金与赔偿金（涉及劳动关系解除或终止）：
- 按劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的应发工资的平均值计算。
- 如果劳动者月平均工资低于当地最低工资标准，则按最低工资标准计算。
- 赔偿金为经济补偿金的二倍，适用于用人单位违法解除或终止劳动合同的情形。
工伤赔偿中的本人工资：
- 指工伤职工因工作遭受事故伤害或患职业病前12个月平均月缴费工资。
- 若缴费工资与实际工资不一致，一般按实际工资（即应发工资）计算，但有上限和下限规定。
特殊情况处理：
- 实际工资难以确定时，可能会参照合同工资，但这种情况较少见。
- 如果双方明确约定以合同工资作为赔偿计算标准，且不违反法律法规强制性规定，则可按合同工资计算。
- 劳动者月工资高于当地职工月平均工资三倍的，经济补偿金的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且最高不超过十二年。
三、为何按应发工资计算赔偿金
- 全面反映劳动者收入：应发工资包含了劳动者的基本工资、奖金、津贴等所有货币性收入，能更全面地反映劳动者的实际收入状况。
- 避免损害劳动者权益：按应发工资计算赔偿金，可以避免将社保、公积金等个人承担部分排除在外，从而损害劳动者的合法权益。
- 确保合理经济补偿：确保劳动者在劳动合同解除或终止后，能够得到与其劳动贡献相匹配的合理经济补偿。
四、实际操作注意事项
- 确保使用应发工资：在计算经济补偿金或赔偿金时，务必确保使用的是应发工资，即包含所有货币性收入的总额。
- 了解自身权益：劳动者应了解自己的权益，确保在面临劳动合同解除或终止时能够获得与其实际贡献和应得收入相符的经济补偿。
- 审查合同条款：劳动者和用人单位在处理相关事宜时，应仔细审查法律规定和合同条款，确保合法权益得到保障。
总结来看，赔偿金的计算基数一般应按照应发工资来确定，但在特定情形下（如实际工资难以确定、双方有明确约定等）也可能考虑实际工资或合同工资。在实际应用中，应根据具体法律关系、法律规定及合同约定来准确判断赔偿金的计算基数。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。