在合同纠纷中，赔偿金额的确定通常遵循合同约定优先，实际损失为辅的原则，具体是按合同上金额还是实际发生的金额，需结合合同条款、实际损失情况以及法律规定来综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同有明确约定的情况
合同约定优先：如果合同中明确规定了赔偿金额或赔偿的计算方式，那么在发生纠纷时，应首先按照合同中的约定来确定赔偿金额。这是基于《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定金额的合理性：虽然合同有约定，但如果约定的赔偿金额过低或过高，与实际损失相差悬殊，受损方可以请求人民法院或仲裁机构进行调整。根据法律规定，约定的违约金低于造成的损失的，可以予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，可以适当减少。
二、合同没有明确约定或约定不明确的情况
实际损失为辅：如果合同中没有明确约定赔偿金额或计算方式，或者约定不明确，那么应参照实际损失来确定赔偿金额。根据《中华人民共和国民法典》第五百八十四条的规定，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益，但不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。
实际损失的计算：在实际损失的计算上，应综合考虑直接损失和间接损失。直接损失是指因违约行为直接导致的财产减少或费用增加，如货物损坏、额外费用等；间接损失则是指因违约行为导致的预期利益丧失，如预期利润、商誉损害等。
三、特殊情况的处理
格式条款的效力：如果合同中的赔偿条款是格式条款，且存在免除或减轻提供格式条款一方责任、加重对方责任、排除对方主要权利等情形的，该格式条款可能被认定为无效。此时，赔偿金额的确定应依据法律规定和实际损失情况。
双方协商：在合同纠纷中，双方也可以协商确定赔偿金额。如果双方能够达成一致意见，且该意见不违反法律法规的强制性规定，那么该协商结果可以作为赔偿金额的依据。
四、实际操作建议
审查合同条款：在签订合同时，应仔细审查合同中的赔偿条款，确保条款明确、合理，并符合自己的利益需求。
保留证据：在合同履行过程中，应保留好与合同履行相关的证据，如交易记录、沟通记录、损失证明等，以便在发生纠纷时能够证明自己的实际损失情况。
及时咨询：如果发生合同纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权益和义务，以及可能的赔偿金额和计算方式。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定如果甲方违约，需向乙方支付合同总金额的20%作为违约金。后来甲方违约，导致乙方遭受了实际损失，但实际损失低于合同总金额的20%。此时，乙方可以要求甲方按照合同约定支付违约金；但如果实际损失高于合同总金额的20%，乙方则可以请求人民法院或仲裁机构增加赔偿金额。
总之，在合同纠纷中，赔偿金额的确定是一个复杂的过程，需要综合考虑合同条款、实际损失情况以及法律规定等多方面因素。如果您有具体的合同纠纷问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。