针对您提出的“公司开除重大疾病员工怎么赔偿”的问题，这确实是一个涉及劳动法的重要议题。赔偿金的计算需严格依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律规定，并结合具体情况来判断。以下是我为您详细梳理的解答：
一、赔偿金计算的基本原则
公司辞退重大疾病员工，赔偿金的计算主要分为合法解除与违法解除两种情况。合法解除时，公司需支付经济补偿及可能的医疗补助费；违法解除时，则需支付二倍经济补偿标准的赔偿金及医疗补助费（如适用）。
二、合法解除时的经济补偿与医疗补助费
经济补偿：
- 经济补偿的计算依据是员工在本单位的工作年限。每满一年，公司需支付一个月工资的标准作为经济补偿。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资的定义是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
- 如果员工的月工资高于当地上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按照三倍数额来支付，但最高支付年限不超过十二年。
医疗补助费：
- 如果员工因患病或非因工负伤，经过劳动鉴定确认不能从事原工作，也不能从事公司另行安排的工作，从而解除劳动合同的，公司应支付不低于六个月工资的医疗补助费。
- 对于患重病的员工，医疗补助费的增加部分不低于原医疗补助费的百分之五十；对于患绝症的员工，增加部分则不低于原医疗补助费的百分之百。
三、违法解除时的赔偿金
- 如果公司辞退重大疾病员工的行为违反了法律规定，例如在员工医疗期内被辞退，那么公司需要支付赔偿金。
- 赔偿金的计算方式是经济补偿标准的二倍，具体计算方法与合法解除时的经济补偿相同。
四、无需支付补偿的特殊情形
当然，也存在一些公司可以合法解除合同且无需支付补偿的特殊情形，包括但不限于：
- 员工在试用期内不符合录用条件（但公司需提供明确证据）。
- 员工严重违反公司规章制度（如旷工、盗窃等行为）。
- 员工严重失职或营私舞弊，给公司造成重大损失。
- 员工被依法追究刑事责任（如刑事判决生效）。
五、实际操作中的注意事项
程序合法性：公司在辞退员工时，需提前三十日书面通知员工或支付代通知金，并通知工会，以确保程序的合法性。
个税处理：补偿金在当地职工平均工资三倍以内的部分免税，超出部分则需按照个人所得税规定缴纳。
证据留存：员工应妥善保留劳动合同、工资流水等证据，以便在必要时维护自身合法权益。
六、具体案例分析
以一个具体案例来说明：假设员工在公司工作了5年，月平均工资为8000元，且未高于当地职工月平均工资的三倍。
- 如果公司违法解除劳动合同，赔偿金将为8000元/月 × 5年 × 2 = 80000元。
- 如果为合法解除，经济补偿将为8000元/月 × 5年 = 40000元。
- 如果该员工经鉴定不能从事原工作也不能从事另行安排的工作而解除合同，医疗补助费至少为8000元/月 × 6个月 = 48000元；若患重病，则至少为72000元（48000元 + 24000元）；若为绝症，则至少为96000元（48000元 × 2）。
综上所述，公司辞退重大疾病员工的赔偿金计算是一个复杂且细致的过程，需综合考虑多种因素。在实际操作中，我建议您咨询专业法律人士以确保合法权益得到妥善处理。希望这个解答能对您有所帮助。