当员工患有重大疾病时，用人单位的处理方式需要兼顾法律义务与人文关怀，确保员工的合法权益得到保护，同时维护企业的正常运营。以下是对此问题的详细解答：
一、医疗期内的处理与待遇
医疗期的确定：
- 根据员工实际参加工作年限和在本单位工作年限，医疗期可给予3个月到24个月不等。具体划分可参照相关法律法规，如实际工作年限10年以下，本单位工作年限5年以下为3个月，5年以上为6个月；实际工作年限10年以上，本单位工作年限5年以下为6个月，以此类推，最长可达24个月。
不得辞退原则：
- 在医疗期内，用人单位不得依照《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，确保员工在患病期间不会因工作问题而面临失业风险。
病假待遇：
- 员工在医疗期内，企业应按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，该费用可以低于当地最低工资标准，但不得低于最低工资标准的80%。同时，用人单位应继续为员工缴纳社会保险费用，确保其享受相应的医疗保障。
休息休假：
- 用人单位应批准员工去休息休假，以便接受治疗并恢复健康。这体现了企业对员工的人文关怀，有助于员工更好地康复。
二、医疗期满后的处理
培训或调岗：
- 医疗期满后，若员工因疾病不能适应原工作，用人单位应为其安排培训或调整工作岗位，以帮助员工重新适应工作环境。
劳动合同的解除与终止：
- 若经过培训或调岗后，员工仍不能适应工作，用人单位在提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，可以依法解除劳动合同，并按规定支付经济补偿金。但需注意，若劳动合同期满，但员工仍在医疗期内的，劳动合同应续延至医疗期满或相应情形消失时终止。
特殊疾病的保护：
- 如果员工患的是职业病或因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力，用人单位不得解除劳动合同，这是法律对特殊疾病员工的额外保护。
三、经济支持与福利保障
社会保险待遇：
- 员工患重大疾病，可依法享受基本医疗保险待遇。用人单位应确保员工医保正常缴纳，并协助办理医保报销手续。若用人单位未依法为员工缴纳社会保险费，导致员工无法享受医疗保险待遇的，用人单位应按照医疗保险待遇标准支付医疗费用。
内部援助计划：
- 用人单位可以启动员工互助基金（如有），为员工提供一次性补助。同时，也可以发起全员募捐，但需遵循自愿原则并公示资金用途，确保透明公正。
商业保险理赔：
- 若企业购买了补充医疗险或重疾险，应指导员工申请理赔，以减轻员工的经济负担。
四、合规处理与风险防控
法律风险防范：
- 用人单位在处理员工患病事宜时，应确保所有操作留痕，如书面通知、沟通记录等，以避免劳动纠纷。同时，建议法务或律师审核重大决策，如解除合同、大额补助等，确保合规性。
长期跟踪机制：
- 用人单位应定期回访员工康复情况，动态调整工作安排。对于家庭经济困难员工，可以协调工会或社会机构提供长期帮扶，体现企业的社会责任感。
五、人文关怀与企业文化
- 用人单位在处理员工患病事宜时，应注重人文关怀，如主动沟通关怀、灵活工作安排等。同时，可以通过内部公告、会议等方式宣传企业对员工的关怀政策，增强企业凝聚力。
综上所述，当员工患有重大疾病时，用人单位应综合考虑法律义务、人文关怀、经济支持与福利保障等多方面因素，确保员工的合法权益得到保护，同时维护企业的正常运营和良好形象。