在综合工时制下，年休假的计算与安排主要遵循《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，同时结合综合工时制的特点进行灵活处理。以下是对综合工时制下年休假计算的详细解答：
一、享受年休假的条件
无论采用何种工时制度，职工只要连续工作满12个月以上，即有权享受带薪年休假。这里的“连续工作”不仅限于在同一用人单位，也包括在不同用人单位的工作时间累计。
二、年休假天数的计算
年休假天数的计算主要依据职工的累计工作时间：
- 累计工作已满1年不满10年的，年休假为5天；
- 已满10年不满20年的，年休假增加到10天；
- 满20年以上的，年休假为15天。
需要注意的是，国家法定休假日、休息日均不计入年休假范畴。
三、年休假在综合工时制下的安排
灵活安排：
- 在综合工时制下，用人单位需根据生产、工作的具体情况，并考虑职工个人意愿，统筹安排年休假。年休假可在1个年度内集中使用，也可分段安排，但一般不得跨年度安排。特殊情况下，因工作需要确需跨年度安排的，应确保职工的年休假权益不受影响。
考虑综合计算周期：
- 综合工时制是采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。在安排年休假时，用人单位应充分考虑综合计算工时的周期特点，确保职工在综合计算周期内能够切实享受到年休假权益。
四、未休年休假的补偿
正常情况：
- 对于应休未休的年休假天数，用人单位应按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，这包含了职工正常工作期间的工资收入。
劳动合同解除或终止时：
- 若用人单位与职工解除或终止劳动合同，且当年度未安排职工休满应休年休假天数的，应按前述标准折算并支付未休年休假工资报酬。但折算后不足1整天的部分不支付未休年休假工资报酬。
五、综合工时制下的特殊考量与示例
特殊考量：
- 在综合工时制下，尽管工作时间计算方式相对灵活，但年休假安排仍需遵循上述基本原则。用人单位在统筹安排年休假时，应确保职工能够切实享受到年休假权益，避免以综合工时制为由剥夺或限制职工的年休假。
示例说明：
- 假设某企业实行以月为周期的综合计算工时制，员工小李累计工作已满5年，应享受5天年休假。若小李在某个月内因工作需要未能休假，企业应在后续月份内安排小李休假，或按照日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬。
六、注意事项
- 程序合规性：实施综合工时制前须经劳动行政部门审批，并在劳动合同中明确约定。
- 记录保存：用人单位应完整留存考勤数据作为争议处理依据，确保年休假安排的透明度和公正性。
- 健康保护：在安排年休假时，用人单位应充分考虑职工的身心健康，避免过度集中工作损害职工的健康权益。
综上所述，综合工时制下的年休假计算与安排需遵循相关法律法规的规定，并结合综合工时制的特点进行灵活处理。用人单位应确保职工能够切实享受到年休假权益，促进劳动关系的和谐稳定。