在综合工时制下，年休假不应算作工时。以下是对这一结论的详细解释和分析：
一、法律依据与原理
年休假的性质：
- 年休假是《职工带薪年休假条例》赋予劳动者的合法权益，旨在保障劳动者在连续工作一定时间后能够有时间休息和放松，恢复体力和精力。年休假是劳动者的一种福利，其本质是为了让劳动者得到充分的休息，而非继续提供劳动。
综合工时制的特点：
- 综合工时制是一种特殊的工时制度，它以一定周期（如周、月、季、年）为单位综合计算工作时间。在这种制度下，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同，但具体的工作时间安排更加灵活。
不计入工时的依据：
- 从工时计算的角度来看，综合工时制下的工时计算主要依据劳动者实际从事工作的时间。年休假期间，劳动者并未实际提供劳动，因此不应将年休假时间计算在工时内。将年休假算作工时违背了设立年休假制度的初衷，即保障劳动者的休息权利。
二、实际操作中的考量因素
工资支付：
- 虽然年休假不算工时，但劳动者在年休假期间是享有带薪待遇的。用人单位应按照劳动者正常工作期间的工资收入支付年休假工资报酬。这一规定确保了劳动者在享受年休假的同时，不会因未实际工作而遭受经济损失。
工时统计与管理：
- 用人单位在统计和管理综合工时制下的工时情况时，应明确区分正常工作时间、加班时间和年休假时间等不同的时间类别。建立健全的考勤制度和工时记录制度对于确保工时计算的准确性和合规性至关重要。这不仅有助于用人单位有效管理员工的工作时间，还能在发生劳动争议时提供有力的证据支持。
合理安排工作与休息：
- 用人单位应合理安排员工的工作和休息时间，确保劳动者在综合计算周期内既能完成工作任务，又能享受到充分的休息。通过合理的工作安排和休息制度，可以提高劳动者的工作效率和满意度，同时降低因过度劳累而导致的健康问题和安全风险。
三、年假天数的确定与计算
年假天数的确定：
- 职工累计工作已满1年不满10年的，年休假为5天；
- 已满10年不满20年的，年休假为10天；
- 已满20年的，年休假为15天。
年假期间工资的计算：
- 年休假期间视为正常出勤，用人单位应按正常出勤应得的工资标准支付报酬。如劳动合同有约定，按约定执行；集体合同标准高于劳动合同的，按集体合同执行。无约定的，可由用人单位与职工代表协商确定，或按劳动者本人所在岗位正常出勤月工资的70%确定（但实际操作中，通常按正常工资支付，此处70%的表述更多是为了涵盖特殊情况下的处理，并非主流做法）。
未休年假的补偿计算：
- 如果用人单位经职工同意不安排年休假或安排天数少于应休天数的，需支付未休年休假工资报酬。按照职工日工资收入的300%支付，其中包含正常工作期间的工资收入。日工资收入按职工月工资除以月计薪天数（21.75天）折算。月工资指职工在用人单位支付未休年休假工资报酬前12个月剔除加班工资后的月平均工资。由于已包含正常工作期间的工资收入，因此实际还需额外支付的金额为日工资收入的200%。
总结与建议：
在综合工时制下，年休假是劳动者依法享有的休息休假权利，不应计入工时总数中。用人单位应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到有效保障。在实际操作中，用人单位应合理安排员工的工作和休息时间，建立健全的考勤制度和工时记录制度，以避免因工时计算不当而引发的劳动争议。如果劳动者对年休假的计算或支付有疑问，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律解答和建议。