结论概述：合同期内请假导致没满工作天数，其处理方式主要取决于请假类型、合同约定以及公司规章制度。以下从不同角度进行详细分析。
一、请假类型与合同约定
法定假期：
- 若请假属于法定假期（如年假、病假、婚假、产假等），且符合法律法规及公司规章制度的规定，则员工有权享受这些假期，且不应因请假而影响工作天数的计算或薪资的发放。
- 法律依据：根据《劳动法》及相关规定，员工享有法定假期，公司应予以保障。
事假：
- 若请假为事假，即员工因个人原因需要请假，则通常需要事先获得公司的批准，并可能影响工作天数的计算和薪资的发放。
- 合同约定：具体影响需查看劳动合同中的相关条款，如事假是否计入工作天数、是否扣减薪资等。若合同中有明确约定，则按合同执行。
病假：
- 病假通常属于法定假期范畴，但具体天数和待遇可能因地区和公司政策而异。
- 医疗期：若员工因病需要长期治疗，可能涉及医疗期的规定。在医疗期内，员工享有相应的待遇和保障，公司不得随意解除劳动合同。
二、公司规章制度
请假流程：
- 公司通常会有明确的请假流程，员工需按照流程进行请假申请。若未按照流程请假，可能被视为旷工或未经批准的缺勤。
- 建议：员工在请假前应仔细阅读公司规章制度，了解请假流程和相关规定。
工作天数计算：
- 公司可能根据规章制度对工作天数进行计算，如将请假天数从总工作天数中扣除。
- 注意：若公司规章制度与劳动合同或法律法规相冲突，应以劳动合同或法律法规为准。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 若员工未经批准擅自缺勤，可能构成旷工，公司有权根据规章制度进行处罚，甚至解除劳动合同。
- 若公司因员工请假而扣减薪资或解除劳动合同，且该行为违反法律法规或劳动合同约定，员工有权向劳动争议调解仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
建议：
- 员工：在请假前应与公司沟通并获得批准，了解请假对工作天数和薪资的影响。若遇到不公正待遇，可寻求法律援助或咨询专业律师。
- 公司：应制定完善的请假制度和规章制度，明确请假流程、工作天数计算和薪资发放等规定。同时，应加强对员工的培训和指导，确保员工了解并遵守相关规定。
总结：合同期内请假导致没满工作天数，其处理方式需综合考虑请假类型、合同约定以及公司规章制度。员工在请假前应与公司沟通并获得批准，了解相关规定和后果。若遇到问题或争议，可咨询专业律师以维护自身合法权益。