核心结论：月工资中若已包含单休（周六）的加班费，周六缺勤时工资的计算方式需根据劳动合同或公司规章制度的约定来确定，常见情况有以下两种：
按缺勤天数扣除相应工资
如果劳动合同或公司规章制度明确规定，月工资中包含周六的加班费，且缺勤时按实际出勤天数计算工资，那么周六缺勤时，公司可能会按照缺勤天数扣除相应的工资。这里的“相应工资”通常是指将月工资总额平均分配到每个工作日（包括周六）后，按缺勤的工作日数进行扣除。例如，若月工资为5000元，每月按26天计算（含4个周六），则每天工资约为192.31元，若周六缺勤1天，则扣除192.31元。
不额外扣除，但可能影响绩效或奖金
有些公司可能采取更为灵活的工资计算方式，即月工资中虽然包含周六的加班费，但缺勤时并不直接扣除工资，而是通过影响绩效评分、奖金发放等方式来体现。这种情况下，周六缺勤可能不会直接导致工资减少，但可能会间接影响员工的总收入。
进一步说明：
劳动合同与规章制度的重要性：无论采取哪种计算方式，关键在于劳动合同或公司规章制度中是否有明确规定。如果合同或制度中有明确条款说明缺勤时的工资计算方式，那么应按照约定执行。
加班费的合法性：根据《劳动法》的规定，休息日（如周六）安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，如果月工资中已包含周六的加班费，且该加班费符合法定标准，那么公司在计算缺勤工资时，应确保不违反这一规定。
沟通与协商：如果员工对周六缺勤时的工资计算方式有疑问或不满，建议首先与公司的人力资源部门或上级进行沟通，了解公司的具体政策和计算方式。如果无法达成一致，可以考虑通过劳动争议调解或仲裁等途径解决。
建议：
为避免因工资计算问题产生纠纷，建议员工在入职时仔细阅读劳动合同和公司规章制度，特别是关于工资计算、加班费支付和缺勤处理等方面的条款。如有疑问，及时向公司咨询或寻求法律帮助。