结论：主审法官未到庭，仅由助理法官参与庭审，这一程序是否合法需分情况讨论，关键在于是否符合法律规定的合议庭组成或独任审理要求，以及是否履行了法定程序。以下从不同角度详细分析：

1. 若案件依法应由合议庭审理

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第183条及《中华人民共和国民事诉讼法》第40条，合议庭由审判员（包括院长、庭长）或审判员与人民陪审员共同组成，主审法官（审判长）必须到庭，否则合议庭组成不完整，程序违法。
具体情形：

• 若法庭笔录显示主审法官未到庭，但助理法官以“代理审判长”身份参与，且法院未提前书面通知当事人并说明理由（如审判长突发疾病），则属于程序瑕疵，可能构成《刑事诉讼法》第238条或《民事诉讼法》第177条规定的“违反法定程序”，当事人可申请二审法院撤销原判、发回重审。
  
• 若助理法官实际行使审判长职权（如主持庭审、决定证据采信），而主审法官未参与任何环节，则程序严重违法，直接剥夺了当事人接受合法审判的权利。

2. 若案件依法可由独任法官审理

根据《刑事诉讼法》第183条（基层法院适用简易程序、速裁程序）及《民事诉讼法》第41条（基层法院适用小额诉讼程序、简易程序），独任法官可独自审理案件，此时无需“主审法官”与“助理法官”共同到庭。
关键点：

• 若法庭笔录误将“独任法官”记载为“助理法官”，或助理法官仅负责记录、维持秩序等辅助工作（如宣读起诉书、核对身份），而实际审判由独任法官完成，则程序合法。
  
• 若助理法官实际替代独任法官作出裁判（如宣判、签署判决书），则属于无权代理，程序违法。

3. 程序违法的法律后果

• 当事人权利救济：根据《刑事诉讼法》第238条或《民事诉讼法》第177条，若程序违法“可能影响公正审判”，二审法院应撤销原判、发回重审。
  
• 法院内部追责：根据《人民法院工作人员处分条例》第44条，法官擅自离岗、委托他人代行职权，可给予警告至记大过处分；情节严重的，降级或撤职。

建议行动

1. 核实庭审记录：要求法院提供完整的庭审录像或书面记录，确认主审法官是否全程缺席、助理法官的具体职权范围。
   
2. 提出异议：若发现程序违法，应在庭审中当场提出（如要求审判长到庭），或在收到判决书后5日内（刑事案件）或10日内（民事案件）上诉，明确以“程序违法”为由请求发回重审。
   
3. 投诉举报：向法院监察部门或上级法院反映法官失职行为，推动内部追责。

总结：主审法官未到庭是否违法，需结合案件审理方式（合议庭/独任）及助理法官的实际职权判断。若程序违法，当事人可通过上诉或投诉维护权益。如有具体案情，可进一步向我咨询细节。