二审开庭询问时仅有法官助理和笔录员（书记员）参加，这样的程序是不合法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律对二审开庭程序的规定

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，第二审人民法院对上诉案件，应当组成合议庭进行审理。合议庭成员人数必须为单数，且应全部出庭共同参与案件的审理。这是为了确保案件审理的公正性和准确性，通过集体智慧和专业判断来作出裁决。法官助理和书记员虽然也是法院工作人员，但他们并不具备独立的审判权，不能替代审判员进行案件审理。

二、当事人诉讼权利的保障

二审开庭是当事人行使上诉权、维护自身合法权益的重要环节。在庭审中，当事人有权充分陈述自己的观点、提供证据、进行辩论等。如果只有法官助理和书记员参加庭审，当事人将无法面对具有审判权的法官进行有效的陈述和辩论，其诉讼权利将无法得到充分保障。这与司法公正和程序正义的原则相悖。

三、法律后果与应对建议

1. 法律后果：

   • 如二审开庭时仅有法官助理和书记员参加，而没有合议庭成员出庭，该庭审程序是不合法的。
   • 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定，审判组织的组成不合法属于严重违反法定程序的情形，所作出的判决、裁定等也可能因此而被视为无效。

2. 应对建议：

   • 遇到此类情况，当事人应及时向相关部门反映，如向法院的监察部门或上级法院提出异议，要求按照法定程序重新审理案件。
   • 当事人也可以保留相关证据，如庭审记录、照片或视频等，以备后续维权之需。

四、特殊情况说明

虽然二审案件原则上应当开庭审理，但根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，经过阅卷、调查和询问当事人，对没有提出新的事实、证据或者理由，合议庭认为不需要开庭审理的，可以不开庭审理。然而，这并不意味着可以仅有法官助理和书记员参加庭审。即使不开庭审理，也应当由合议庭成员进行阅卷、调查和询问当事人等工作。

总结与建议：

二审开庭询问时仅有法官助理和笔录员（书记员）参加是不合法的。当事人应当了解并维护自己的诉讼权利，确保案件能够按照法定程序进行审理。如果遇到此类情况，建议及时向相关部门反映并要求重新审理。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。