结论：二审不开庭由法官独任审理，且法官助理担任法庭记录、书记员不出庭记录庭审笔录的情况，在特定条件下是合法的，但需严格遵循法律规定。以下是对此问题的详细分析：
二审不开庭审理的合法性：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，二审法院在特定情况下可以不开庭审理。这通常适用于案件事实清楚、证据充分，且上诉人或辩护人未提出新的事实、证据或理由，或者虽然提出但不影响定罪量刑的情况。
- 在不开庭审理的情况下，二审法院会通过阅卷、讯问被告人、听取其他当事人、辩护人、诉讼代理人的意见等方式进行审理。
法官独任审理的合法性：
- 通常情况下，二审案件由合议庭进行审理。但在某些特定情况下，如案件事实清楚、权利义务关系明确、争议不大的简单民事案件，或者法律另有规定的，可以由审判员一人独任审理。不过，在刑事案件中，二审独任审理的情况较为罕见，且需严格符合法律规定。
- 若法律或司法解释明确规定了二审可以独任审理的情形，且该案件符合这些情形，则法官独任审理是合法的。
法官助理担任法庭记录的合法性：
- 法官助理在法官的指导下，可以协助法官进行案件审理工作，包括整理案卷材料、草拟法律文书等。在特定情况下，如书记员缺席或无法履行职责时，法官助理可以在法官的授权下担任法庭记录。
- 但需注意，法官助理担任法庭记录并非其常规职责，且需确保记录的准确性和完整性。若法律或法院内部规定对法庭记录有特定要求（如必须由书记员担任），则法官助理担任法庭记录可能不符合规定。
书记员不出庭记录庭审笔录的合法性：
- 书记员是法庭审理过程中的重要角色，负责记录庭审过程、整理案卷材料等。在正常情况下，书记员应当出庭记录庭审笔录。
- 若书记员因故无法出庭，且法院未安排其他书记员或法官助理接替其职责，则可能导致庭审笔录记录不全或缺失，这可能影响案件的审理和判决。然而，如果法院采取了其他措施（如使用录音录像设备记录庭审过程）来确保庭审记录的完整性和准确性，且这些措施符合法律规定，则书记员不出庭记录庭审笔录可能不构成违法。
- 但需特别强调：在刑事案件中，庭审笔录的记录是至关重要的，它直接关系到案件的审理和判决。因此，除非有极其特殊的情况且法院采取了充分的保障措施，否则书记员不出庭记录庭审笔录是不被推荐的，也可能不符合法律规定。
综合分析：
- 二审不开庭由法官独任审理，在特定条件下是合法的。
- 法官助理在特定情况下可以担任法庭记录，但需确保记录的准确性和完整性，并符合法律或法院内部规定。
- 书记员不出庭记录庭审笔录在正常情况下是不被推荐的，也可能不符合法律规定。除非有极其特殊的情况且法院采取了充分的保障措施（如使用录音录像设备记录庭审过程）。
建议：
- 若您面临类似情况，建议首先查阅相关法律法规和司法解释，了解二审不开庭审理、法官独任审理、法庭记录以及庭审笔录记录的具体规定。
- 若对法院的审理程序或记录方式有疑问或不满，可以及时向法院提出异议或申请复议。
- 如有需要，您可以向我进一步咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。