公司禁止员工抽烟是否合法，主要取决于该禁令的制定依据及实施范围。以下从不同角度为你详细分析：

1. 若公司禁令基于法律法规：

   • 根据国家卫生计生委起草的《公共场所控制吸烟条例（送审稿）》以及各地出台的具体控制吸烟条例，许多特定的室内公共场所是明确禁止吸烟的，这些规定通常涵盖公共交通工具内、室内工作场所（如国家机关、企事业单位、社会团体的办公室、会议室等）、医疗卫生机构和教育机构等。
   • 若公司所在的室内区域属于上述法律法规明确规定的禁止吸烟范围，那么公司禁止员工抽烟是合法的，且员工违反将可能面临警告、罚款等行政处罚。具体处罚标准因地区而异，例如在北京市，个人在禁止吸烟场所吸烟的，首次可被处以50元罚款，拒不改正的可处以200元罚款。

2. 若公司禁令基于内部规章制度：

   • 即使公司所在的室内区域不在相关法律法规规定的禁止吸烟范围内，公司也有权根据自身实际情况和员工需求，制定合理的禁烟政策或设立指定的吸烟区。
   • 在这种情况下，公司禁止员工抽烟的合法性取决于该规章制度的制定程序是否合法、内容是否合理且不违反法律法规的强制性规定。如果规章制度经过民主程序制定，且内容合法合理，那么员工违反该禁令将可能受到公司内部纪律处分，包括警告、罚款、甚至解除劳动合同等。

3. 特殊情况与建议：

   • 健康与环境考量：除了法律因素外，抽烟对同事健康和工作环境的不良影响也是不容忽视的。因此，即使公司禁令在某些情况下可能不具有直接的法律依据，但出于对员工健康和工作环境的考虑，公司制定禁烟政策也是值得倡导的。
   • 灵活管理：公司可以根据自身情况和员工需求，制定既符合法律法规又兼顾员工利益的禁烟政策。例如，可以设立指定的吸烟区，或者规定特定的吸烟时间等。

总结与建议：

• 作为员工，应首先了解并遵守相关法律法规和公司规章制度中关于禁烟的规定。
• 如果对公司禁令有疑问或不满，可以通过合法途径与公司沟通协商，寻求合理的解决方案。
• 作为公司，在制定禁烟政策时，应确保政策的合法性和合理性，并充分考虑员工的实际需求和利益。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）或其他法律领域的问题，欢迎直接向我咨询。