结论：包工头能否打赢官司，取决于多个因素，包括合同约定、证据情况以及法律规定等。若包工头无法提供钢筋、混凝土的合格证，且合同中有明确约定或法律规定必须提供，同时包工头无法证明材料合格或业主已实际使用且未提出异议，则包工头可能面临不利后果；反之，若包工头能提供其他证据证明材料合格或符合约定，则可能有机会打赢官司。

分析：

1. 合同约定：

   • 首先，需要查看农村自建房的施工合同中是否有明确约定包工头需要提供钢筋、混凝土的合格证。如果合同中有明确约定，而包工头无法提供，则可能构成违约，业主有权要求包工头承担违约责任，甚至可能因此解除合同或要求赔偿损失。
   • 如果合同中没有明确约定，则包工头无法提供合格证可能不直接构成违约，但业主仍可能以材料不合格为由提出抗辩或要求赔偿。

2. 证据情况：

   • 包工头虽然无法直接提供钢筋、混凝土的合格证，但如果能提供其他证据证明材料合格，如购买凭证、质量检测报告（即使非官方）、供应商的质量保证等，也可能有助于证明其主张。
   • 业主若主张材料不合格，也需要提供相应的证据，如自行委托的质量检测报告等。

3. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，建筑材料、建筑构配件和设备等应当符合国家规定的质量标准，并有相应的质量合格证明文件。若包工头使用的材料确实不符合质量标准，且无法提供合格证，则可能面临法律责任。
   • 但同时，如果业主已经实际使用了房屋，且在使用过程中未提出材料质量问题的异议，也可能被视为对材料质量的认可。

4. 实际使用情况：

   • 如果房屋已经建成并交付使用，且业主在使用过程中未提出材料质量问题的异议，这可能成为包工头的一个抗辩理由。然而，这并不意味着包工头可以完全免除责任，因为材料质量是房屋安全的基础，业主可能在后续发现质量问题后仍可追究包工头的责任。

建议：

• 包工头：应尽快收集并整理所有能证明材料合格的证据，如购买凭证、供应商的质量保证等，并与业主进行沟通协商，寻求和解或调解。如果无法达成一致，应考虑咨询专业律师，评估诉讼风险，并准备相应的法律策略。
• 业主：如果认为材料不合格，应尽快委托专业机构进行质量检测，并保留好相关证据。同时，与包工头进行沟通协商，要求其提供合格证或承担相应责任。如果协商无果，也可以考虑通过法律途径解决纠纷。

后续思考：

• 在农村自建房等私人建设项目中，由于合同意识不强、证据保留不完善等原因，纠纷时有发生。因此，建议双方在签订合同时明确约定材料质量标准、合格证提供等事项，并在施工过程中注意保留相关证据，以避免或减少纠纷的发生。
• 如果发生纠纷，双方应首先尝试通过协商、调解等方式解决，以节省时间和成本。如果无法达成一致，再考虑通过法律途径解决。