结论：公司给员工签劳务协议时让员工每天工作12小时按小时计费，这种做法可能违规，具体取决于是否符合相关法律法规中关于工作时间和加班费支付的规定。

分析：

1. 工作时间限制：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间一般不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果公司要求员工每天工作12小时，这明显超出了法定工作时间限制。
   • 即使双方签订的是劳务协议，而非劳动合同，但如果实质上构成了劳动关系（如公司对员工进行管理、支付工资等），则仍应受劳动法的调整。

2. 加班费支付：

   • 如果员工每天工作12小时，超出8小时的部分应视为加班。根据劳动法，加班应支付加班费，且加班费的支付标准有明确规定（如工作日加班支付不低于工资150%的加班费，休息日加班且不能安排补休的支付不低于工资200%的加班费，法定节假日加班支付不低于工资300%的加班费）。
   • 如果公司仅按小时计费，且未按照法定标准支付加班费，则构成违规。

3. 劳务协议与劳动合同的区别：

   • 劳务协议通常适用于非全日制、临时性或特定项目的工作，而劳动合同则适用于全日制、长期性的劳动关系。
   • 如果员工的工作性质、工作时间、管理方式等更符合劳动关系的特征，即使签订的是劳务协议，也可能被认定为劳动关系，从而受劳动法的全面保护。

建议：

• 对于员工：

  • 首先确认自己与公司之间的关系是劳务关系还是劳动关系。如果实质上构成了劳动关系，则公司应遵守劳动法的相关规定。
  • 如果公司要求加班但未支付加班费，员工有权要求公司支付，并可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

• 对于公司：

  • 应确保与员工签订的协议类型（劳务协议或劳动合同）与实际工作关系相符。
  • 如果要求员工加班，应按照法定标准支付加班费，以避免法律风险。
  • 考虑调整工作时间安排，确保符合劳动法的规定，保障员工的合法权益。

可能后果：

• 如果公司违规要求员工加班且未支付加班费，可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
• 员工有权要求公司支付拖欠的加班费，并可能因此解除劳动合同（如果是劳动关系的话）并要求公司支付经济补偿。

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